结论：员工能证明自己出勤但单位以无考勤记录扣钱，这一行为是否合法，需根据具体情况来判断，不一定不合法，但单位需承担举证责任，且扣钱需有合理依据。以下从不同角度进行分析：
单位举证责任与考勤制度
单位需证明考勤制度合法有效：
- 单位应建立合法、合理的考勤制度，并确保员工知晓该制度。若单位无法证明考勤制度的存在或员工不知晓该制度，则单位以无考勤记录为由扣钱可能缺乏合法依据。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。
单位需证明员工未出勤或考勤异常：
- 若单位主张员工未出勤或考勤异常，应提供充分的证据，如考勤记录、监控录像、同事证言等。若单位无法提供这些证据，则其扣钱行为可能缺乏事实依据。
- 实践操作：在实际操作中，单位应妥善保存考勤记录等相关证据，以备不时之需。同时，单位也应鼓励员工对考勤记录进行确认，以减少纠纷的发生。
员工证明出勤的方式与效力
员工可通过多种方式证明出勤：
- 员工可以通过工作记录、同事证言、邮件往来、工作成果等方式证明自己已出勤。这些证据应能够形成完整的证据链，证明员工在特定时间段内确实在工作岗位上。
- 示例：员工可以提供当天的工作邮件、与同事的聊天记录、完成的工作任务等，以证明自己已出勤。
员工证明出勤的效力：
- 若员工提供的证据能够充分证明其已出勤，且单位无法提供相反证据，则单位以无考勤记录为由扣钱的行为可能被认定为违法。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第六条，发生劳动争议，当事人对自己提出的主张，有责任提供证据。与争议事项有关的证据属于用人单位掌握管理的，用人单位应当提供；用人单位不提供的，应当承担不利后果。
单位扣钱的合理性与合法性
单位扣钱需有合理依据：
- 单位扣钱应基于合法、合理的依据，如员工违反考勤制度、造成经济损失等。若单位无法提供这些依据，则其扣钱行为可能缺乏合法性。
- 实践建议：单位在制定扣钱制度时，应明确扣钱的条件、标准和程序，并确保这些制度符合法律法规的规定。同时，单位也应向员工充分说明扣钱制度的内容，以确保员工的知情权。
单位扣钱需符合法定程序：
- 单位在扣钱前，应告知员工扣钱的原因、金额和依据，并听取员工的陈述和申辩。若单位未履行这些程序，则其扣钱行为可能被认定为违法。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十条，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令。同时，根据相关法律法规，单位在扣钱前应履行相应的告知和听证程序。
建议：若员工遇到单位以无考勤记录为由扣钱的情况，应首先与单位沟通协商，要求单位提供扣钱的依据和证据。若单位无法提供或拒绝提供，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。同时，员工在平时也应注意保存相关证据，以备不时之需。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。