结论：公司能否在员工上班请假时扣除安全奖，需根据具体情况判断，包括公司规章制度、劳动合同约定以及请假性质等因素。
分析：
公司规章制度与劳动合同约定：
- 公司规章制度：如果公司的规章制度中明确规定了请假会扣除安全奖，且该规章制度已经过民主程序制定并公示，或者已经告知员工，那么公司有权根据规章制度扣除安全奖。但需注意，规章制度的内容必须合法合理，不得违反法律法规的强制性规定。
- 劳动合同约定：如果劳动合同中明确约定了请假会扣除安全奖，那么公司也有权根据劳动合同的约定进行扣除。劳动合同是双方自愿签订的，具有法律约束力，双方应遵守合同约定。
请假性质：
- 事假：如果员工请的是事假，且公司规章制度或劳动合同中明确规定了事假会扣除安全奖，那么公司扣除安全奖是合理的。
- 病假、年假等法定假期：对于病假、年假等法定假期，公司通常不能随意扣除安全奖。因为这些假期是员工依法享有的，公司应保障员工的合法权益。如果公司规章制度或劳动合同中对此有特别规定，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么可以按照规定执行。但需注意，这种特别规定应合理且公平，不得损害员工的合法权益。
法律法规的强制性规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》等相关法律法规，公司应保障员工的劳动报酬和福利待遇。如果扣除安全奖违反了法律法规的强制性规定，如最低工资标准、加班费支付等，那么公司的扣除行为是违法的。
建议：
- 员工：如果公司扣除安全奖的行为违反了公司规章制度、劳动合同约定或法律法规的强制性规定，员工可以与公司协商解决，或者向劳动监察部门投诉，甚至通过法律途径维护自己的合法权益。
- 公司：公司在制定规章制度和劳动合同时，应明确请假与安全奖扣除的关系，并确保规章制度和劳动合同的合法性和合理性。同时，公司在执行规章制度时，应公平、公正、公开，避免损害员工的合法权益。
后续行动：
- 如果您对公司的扣除行为有疑问或不满，建议您先查阅公司规章制度和劳动合同的相关条款，了解公司的具体规定。
- 如果您认为公司的扣除行为违反了法律法规或合同约定，您可以与公司进行协商，或者向当地的劳动监察部门投诉。
- 如有需要，您也可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。