可以起诉，但能否胜诉及实现债权需结合具体情况分析。以下从不同角度为你详细说明：
- 诉讼时效角度
根据《民法典》第188条，普通诉讼时效为3年，自权利人知道或应当知道权利受损之日起算。若对方在发票认证后明确表示不付款（如书面拒付通知），或你曾催款但对方未回应，此时诉讼时效开始计算。
- 若3年内未催款或对方未明确拒付：诉讼时效可能未起算，你仍可起诉并主张债权。
- 若3年内已催款但无证据：对方可能以“诉讼时效已过”抗辩，导致败诉风险。
- 若3年内有催款证据（如微信、邮件、律师函等）：诉讼时效中断并重新计算3年，你仍可起诉。
发票认证与付款义务的关系
发票认证仅证明对方已抵扣税款，但不直接等同于承认债务。需结合合同、送货单、对账单等证据，证明双方存在买卖/服务关系及对方未付款的事实。若仅有发票而无其他证据，可能面临举证不足的风险。
对方抗辩的可能情形
- 质量异议：若对方主张货物/服务存在质量问题，可能拒绝付款或要求扣款。此时需审查合同是否约定质量检验期及异议期限。
- 付款条件未成就：若合同约定“验收后付款”或“分期付款”，需确认条件是否已满足。
- 已过诉讼时效：如前所述，若对方提出时效抗辩且你无法证明时效中断，可能败诉。
- 建议行动步骤
- 收集证据：整理合同、送货单、对账单、催款记录、发票认证信息等，形成完整证据链。
- 发送律师函：若证据充分，可先委托律师发函催款，固定对方拒付事实，同时可能促使对方协商解决。
- 及时起诉：若协商无果，建议在诉讼时效内起诉，避免因拖延丧失权利。
- 申请财产保全：起诉时可申请冻结对方银行账户或等值财产，防止转移资产。
总结：发票认证后未付款超过3年仍可起诉，但需结合证据和诉讼时效综合判断。建议尽快梳理材料并咨询专业律师，制定具体诉讼策略。如有进一步问题，可直接向我提问。