针对您提出的“开发票对方公司不给钱三年了还能起诉吗”这一问题，我可以明确地告诉您，即使已经过去了三年，您仍然有权向法院提起诉讼来维护自己的合法权益。

法律依据与诉讼时效

首先，根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。这意味着，在您开具发票后，如果对方未支付款项，您有三年的时间来向法院提起诉讼。虽然您提到已经过去了三年，但这里需要明确的是，诉讼时效的起算点通常是从您知道或应当知道权利受到侵害之日起计算。如果在这三年内，您有向对方催款、对方有承诺付款等行为，都可能导致诉讼时效的中断或重新计算。因此，具体是否已过诉讼时效，还需要结合您的实际情况来判断。不过，即便从开具发票之日起算已满三年，也并不意味着您就完全丧失了起诉的权利，因为法律还规定了诉讼时效中止、中断等情形。

此外，《中华人民共和国民法典》第五百七十九条也明确指出，当事人一方未支付价款等金钱债务的，对方可以请求其支付。这为您起诉对方公司提供了直接的法律依据。

起诉前的准备工作

在决定起诉前，您需要做好以下准备工作：

1. 全面收集证据：

   • 保留好发票原件，这是证明交易内容和金额的关键证据。
   • 找出交易合同或协议，明确双方的权利义务、交易方式、付款时间等。
   • 整理好与对方的沟通记录，如邮件、短信、微信聊天记录等，这些可以佐证交易事实及对方的态度。
   • 如果有交货凭证，如交货单、物流单据等，也应一并保留，以证明货物已交付。
   • 其他相关证据，如对账单、收条等，也可以进一步证明交易及欠款事实。

2. 确定被告信息：确保您掌握的对方公司的身份信息准确无误，包括公司名称、地址、联系方式等。

3. 撰写起诉状：在起诉状中，您需要清晰阐述原被告的基本信息、诉讼请求、事实与理由。

起诉流程与配合事项

接下来，您可以按照以下流程进行起诉：

1. 提交材料：将起诉状及所有证据材料一并提交给有管辖权的法院。

2. 法院受理与审理：

   • 法院会审查您提交的材料，如果符合立案条件，会予以受理。
   • 之后，法院会安排开庭审理，双方当事人需要进行举证、质证、辩论等环节。
   • 在这个过程中，您需要积极配合法院的调查和取证工作。

3. 判决与执行：

   • 如果法院判决您胜诉，而对方未在规定时间内履行判决，您可以向法院申请强制执行。
   • 法院会采取一系列执行措施，如查询、冻结、划扣被告的银行账户等，以实现您的债权。

风险防范建议

为了避免类似情况再次发生，我建议您在未来的交易中采取以下风险防范措施：

• 明确约定：在合同签订时，详细约定付款及开发票的流程和时间节点，以减少纠纷的发生。
• 开具收条：如果对方提出先开发票后付款的要求，您应让对方开具发票收条，并注明款项未结清。
• 定期对账：定期与客户进行对账，及时发现并处理欠款问题。
• 法律咨询：在交易过程中，如果遇到复杂情况或不确定事项，建议及时咨询专业律师，以确保自身权益得到妥善保护。

综上所述，即使已经过去了三年，您仍然有权通过法律途径来维护自己的合法权益。在起诉前做好充分准备，遵循正确的起诉流程，并积极配合法院工作，将有助于提高胜诉的几率。同时，加强风险防范意识，采取有效措施预防类似纠纷的发生，也是保障自身权益的重要一环。