结论：单位在实习完一年后才签协议书是否违法，需根据具体情况判断，主要看实习期间双方的关系性质以及协议书的具体内容。以下从不同角度进行分析：

1. 实习期间双方关系性质

   • 若实习期间被认定为劳动关系：根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，用人单位自用工之日起即与劳动者建立劳动关系，且应当自用工之日起一个月内订立书面劳动合同。若实习期间实际上已经构成了劳动关系（例如，实习生接受单位的管理、从事单位安排的有报酬的劳动等），而单位在实习完一年后才签订协议书，那么单位的行为可能构成违法，因为单位未在法定期限内与劳动者签订书面劳动合同。
   • 若实习期间被认定为非劳动关系：如果实习期间双方明确约定为实习关系，且实习生不接受单位的管理、不从事单位安排的有报酬的劳动，或者实习的主要目的是为了学习、实践等，而非提供劳动，那么这种情况下，实习期间可能不构成劳动关系。此时，单位在实习完一年后签订协议书，可能并不违法，但具体还需看协议书的内容以及双方的实际约定。

2. 协议书的具体内容

   • 若协议书为劳动合同：如果实习结束后签订的协议书实质上为劳动合同，且实习期间已经构成了劳动关系，那么单位未在实习期间签订劳动合同，而在实习结束后签订，可能面临支付双倍工资等法律责任（根据《劳动合同法》第八十二条的规定，用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资）。
   • 若协议书为其他类型协议：如果协议书并非劳动合同，而是其他类型的协议（如实习协议、合作协议等），且双方对实习期间及实习结束后的权利义务有明确约定，那么单位在实习完一年后签订该协议，可能并不直接构成违法，但需确保协议内容不违反法律法规的强制性规定，且不损害实习生的合法权益。

建议：

• 对于实习生而言，如果实习期间已经构成了劳动关系，而单位未在法定期限内签订劳动合同，可以与单位协商要求签订劳动合同，并保留好相关证据（如工作证、考勤记录、工资支付记录等），以备后续维权之需。
• 对于单位而言，应明确实习期间双方的关系性质，并在实习开始前或实习期间及时与实习生签订书面协议，明确双方的权利义务，以避免潜在的法律风险。

可能后果：

• 如果单位的行为被认定为违法，可能面临支付双倍工资、赔偿损失等法律责任。
• 如果双方因此产生纠纷，可能需要通过劳动仲裁或诉讼等途径解决，这将耗费双方的时间和精力。

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