结论：市政工程合同中业主签订的单位和中标通知中的业主不一样，是否合法需分情况讨论，不能一概而论。

分析：

1. 若存在合法授权或委托关系：

   • 在某些情况下，中标通知中的业主（即招标人）可能因特定原因（如内部管理架构调整、项目特殊需求等）授权或委托另一单位作为合同签订方。这种情况下，只要该授权或委托关系合法有效，且符合相关法律法规的规定，那么合同签订方与中标通知中的业主不一致是合法的。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》中关于代理的规定，被代理人对代理人的代理行为，承担民事责任。因此，如果存在合法的代理关系，合同签订方的行为应视为中标通知中业主的行为，合同具有法律效力。

2. 若不存在合法授权或委托关系：

   • 如果合同签订方并未获得中标通知中业主的合法授权或委托，而是擅自以业主名义签订合同，那么这种行为可能构成无权代理或冒名签订合同，是违法的。
   • 法律后果：在这种情况下，合同可能因缺乏合法主体而无效，或者对中标通知中的业主不产生法律效力。同时，擅自签订合同的单位或个人可能需要承担相应的法律责任，如赔偿损失等。

3. 特殊情况考虑：

   • 还需要考虑是否存在政府特许经营、PPP项目等特殊情况。在这些项目中，可能涉及多个主体之间的复杂关系，包括政府、项目公司、运营商等。因此，合同签订方与中标通知中的业主不一致可能是项目特殊安排的一部分，只要符合相关法律法规和项目协议的规定，就是合法的。

建议：

• 核实身份与授权：在签订市政工程合同时，务必核实合同签订方的身份和授权情况，确保其有权代表中标通知中的业主签订合同。
• 审查合同条款：仔细审查合同条款，确保合同内容合法、合规，并明确双方的权利和义务。
• 咨询专业律师：如果对合同签订方的身份或授权情况存在疑问，或者对合同条款有不明之处，建议咨询专业律师以获取法律意见。

后续行动：

• 如果您已经遇到了市政工程合同中业主签订的单位和中标通知中的业主不一致的情况，并且对此存在疑问或担忧，可以直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供详细的法律分析和建议。