结论：公司坚持报警后，您可能面临税务调查、行政处罚甚至刑事追责风险，但积极配合调查、争取从宽处理是关键。以下从法律后果、应对措施、风险防范三个角度展开分析：

一、法律后果分析

1. 行政责任风险
   根据《发票管理办法》第三十五条，虚开发票金额在1万元以下的，可处5万元以下罚款；超过1万元的，处5万元以上50万元以下罚款。您虚开金额达2万余元，已达到行政处罚标准，税务机关可能对您个人或公司处以罚款，并没收违法所得。

2. 刑事责任风险
   若虚开发票行为被认定为“情节严重”（如虚开税款数额1万元以上），可能触犯《刑法》第二百零五条之一虚开发票罪，处二年以下有期徒刑、拘役或管制，并处罚金。但您已主动退款，属于“积极弥补损失”的情节，可在量刑时作为从轻或减轻处罚的依据。

3. 公司连带责任
   若公司明知您虚开发票仍接受，可能被认定为共同违法或犯罪主体，面临税务处罚或刑事追责。但公司报警行为本身不直接加重您的责任，反而可能通过配合调查争取从宽处理。

二、当前应对措施

1. 立即配合调查

   • 主动向税务机关或公安机关说明情况，提交退款凭证、合同、沟通记录等证据，证明您无主观恶意或非法获利目的。
     
   • 强调退款行为系“主动纠正”，而非被迫，体现悔过态度。

2. 争取行政和解或刑事和解

   • 若仅涉及行政处罚，可申请听证程序，提出从轻处罚的请求（如初犯、积极退款、配合调查等）。
     
   • 若进入刑事程序，可尝试与受害方（如公司）达成和解，取得谅解书，为后续争取缓刑或不起诉创造条件。

3. 谨慎处理与公司的关系

   • 避免与公司产生冲突，保留书面沟通记录（如邮件、微信），防止公司补充指控您“胁迫”或“欺诈”。
     
   • 若公司存在过错（如要求您虚开发票），可委婉提示调查机关注意，但需谨慎表述，避免被认定为“推卸责任”。

三、长期风险防范

1. 完善财务合规制度

   • 若您是公司员工，建议推动公司建立发票审核机制，明确禁止虚开发票行为，并留存培训记录。
     
   • 若您是公司负责人，需定期自查财务流程，确保发票开具与实际业务一致。

2. 学习税法合规知识

   • 虚开发票的认定不局限于“无真实交易”，还包括“金额不符”“数量不符”等情形。例如，若实际交易金额为1万元，但开具2万元发票，仍可能构成虚开。
     
   • 关注税务机关发布的典型案例，了解执法尺度（如“善意取得虚开发票”的认定标准）。

3. 保留证据链

   • 未来交易中，务必留存合同、物流单据、付款凭证等原始材料，形成“业务-发票-资金”三流一致的证据链，避免被误认为虚开。

最后提醒：当前阶段，您的核心目标是通过配合调查、主动退款、争取谅解等方式，尽可能降低法律风险。若公司已报警，建议尽快委托专业律师介入，协助与执法机关沟通，制定辩护策略。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。