在合议庭审理后当事人申请回避被准许的情况下，已开过庭的笔录处理需依据《民事诉讼法》及相关司法解释的规定进行，具体处理方式如下：

1. 笔录效力不受影响
   根据《民事诉讼法》第48条，回避决定作出前，审判人员已进行的诉讼活动（包括庭审笔录）原则上有效。除非当事人能证明审判人员存在《民事诉讼法》第47条规定的法定回避情形（如与案件有利害关系、接受当事人请客送礼等），且该情形可能影响公正审判，否则已形成的庭审笔录仍具有法律效力，无需重新制作。

2. 特殊情形下的补正或重新审理

   • 程序瑕疵补正：若回避申请被准许后，法院发现原庭审笔录存在记录错误、遗漏关键信息等程序瑕疵，可依据《民事诉讼法》第157条，通过补正裁定或组织当事人质证后补充记录的方式完善笔录。
     
   • 影响公正审判的重新审理：若当事人能证明原审判人员因回避事由（如偏袒一方）导致庭审程序严重违法，可能影响案件公正判决，法院可依据《民事诉讼法》第177条，裁定撤销原判决，发回重审或直接改判。此时，原庭审笔录可能作为“程序违法”的证据被审查，但并非直接无效。

3. 后续程序衔接

   • 更换审判人员后继续审理：回避被准许后，法院需重新组成合议庭或指定其他审判人员继续审理案件。新审判人员应依据原庭审笔录（经审查合法有效的部分）及后续补充证据推进程序，避免重复举证质证。
     
   • 当事人权利保障：当事人有权对原庭审笔录中记载的陈述、证据提出异议，新审判人员需在后续程序中予以审查并作出认定。

实务建议：

• 当事人若认为原庭审笔录存在程序违法或影响公正的情形，应在申请回避时一并提出笔录异议，并附相关证据（如录音、证人证言等）。
  
• 法院在审查回避申请时，应主动核查原庭审笔录的合法性，避免因程序瑕疵导致后续裁判被撤销。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体案件中的笔录处理问题。