结论：在工伤认定已经受理40天后，公司一般不能随意推翻该认定结果，但存在特定情形下公司可以提出异议或申请重新鉴定。

分析说明：

1. 工伤认定的法律效力：

   • 工伤认定是由社会保险行政部门根据法定程序作出的行政确认行为，一旦作出并送达当事人，即产生法律效力。
   • 在工伤认定受理后的40天内，如果社会保险行政部门已经作出了认定决定，并且该决定已经送达给公司和员工，那么该认定结果就具有了法律效力，公司不能随意推翻。

2. 公司推翻工伤认定的可能性：

   • 特定情形下的异议权：虽然工伤认定具有法律效力，但如果公司有证据证明该认定存在错误或违法情形，如认定事实不清、证据不足、适用法律错误等，公司可以在法定期限内向作出工伤认定的社会保险行政部门提出异议或申请重新鉴定。但需要注意的是，这种异议或申请重新鉴定并不是随意的，而是需要基于充分的证据和理由。
   • 行政复议或行政诉讼：如果公司对社会保险行政部门的工伤认定决定不服，还可以在法定期限内依法申请行政复议或提起行政诉讼。但同样，这需要公司有充分的证据和理由来支持其复议或诉讼请求。

3. 实际操作中的注意事项：

   • 及时关注认定进展：公司应密切关注工伤认定的进展情况，及时了解认定结果，并在法定期限内行使自己的权利。
   • 准备充分证据：如果公司认为工伤认定存在错误或违法情形，应尽快收集相关证据，以便在提出异议或申请重新鉴定时能够有力支持自己的观点。
   • 遵守法定程序：无论是提出异议、申请重新鉴定还是申请行政复议或提起行政诉讼，公司都需要严格遵守法定程序，确保自己的权利得到有效行使。

法律建议：

• 如果公司对工伤认定结果有异议，建议首先与社会保险行政部门进行沟通，了解认定结果的依据和理由，看是否存在误解或沟通不畅的情况。
• 如果沟通无果，且公司确实有证据证明工伤认定存在错误或违法情形，那么公司可以在法定期限内依法提出异议、申请重新鉴定或申请行政复议、提起行政诉讼。
• 在整个过程中，公司应咨询专业律师的意见，以确保自己的权利得到有效维护。

后续行动：

• 如果您作为公司方，对工伤认定结果有异议，并希望进一步了解如何提出异议或申请重新鉴定等具体操作流程，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议和指导。