结论：在仲裁调解过程中，如果双方对解除劳动合同的经济补偿金存在分歧，但仅就工资部分达成一致，是可以仅就工资部分进行调解的。
详细分析：
仲裁调解的灵活性：
- 仲裁调解是劳动争议解决的一种方式，其核心在于双方自愿、平等协商，以达成和解协议。在这个过程中，双方可以就争议的所有内容或部分内容进行协商和调解。
- 如果双方对解除劳动合同的经济补偿金存在分歧，但这并不妨碍他们就工资等其他争议事项进行调解。调解的灵活性允许双方根据实际情况，选择性地解决争议。
工资调解的独立性：
- 工资是劳动者应得的劳动报酬，与解除劳动合同的经济补偿金是两个独立的法律概念。因此，工资争议的调解并不依赖于经济补偿金的调解结果。
- 如果双方仅就工资部分达成一致，仲裁机构可以就工资部分制作调解书，该调解书具有法律效力，双方应当履行。
经济补偿金的后续处理：
- 如果双方在经济补偿金问题上无法达成一致，这并不影响工资调解的效力。经济补偿金的问题可以继续通过仲裁或诉讼等法律途径解决。
- 劳动者在仲裁或诉讼过程中，仍然可以主张其应得的经济补偿金，并提交相关证据支持其主张。
实际操作建议：
- 在仲裁调解过程中，劳动者应明确自己的诉求，并就工资和经济补偿金等问题分别与用人单位进行协商。
- 如果双方仅就工资部分达成一致，劳动者应要求仲裁机构就工资部分制作调解书，并确保调解书的内容明确、具体，以便后续执行。
- 对于经济补偿金问题，如果双方无法达成一致，劳动者可以在调解结束后，继续通过仲裁或诉讼等法律途径维护自己的合法权益。
法律背景：
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，仲裁庭在作出裁决前，应当先行调解。调解达成协议的，仲裁庭应当制作调解书。调解书应当写明仲裁请求和当事人协议的结果，并由仲裁员签名，加盖劳动争议仲裁委员会印章，对双方具有约束力。
- 如果调解不成或者调解书送达前，一方当事人反悔的，仲裁庭应当及时作出裁决。这意味着，调解是自愿的，且调解不成并不影响后续的仲裁或诉讼程序。
建议：
- 在仲裁调解过程中，劳动者应充分了解自己的法律权益，并就工资和经济补偿金等问题与用人单位进行充分协商。
- 如果双方无法就所有争议事项达成一致，劳动者可以选择仅就部分事项进行调解，并确保调解书的内容明确、具体。
- 对于未达成一致的事项，劳动者可以在调解结束后，继续通过法律途径维护自己的合法权益。
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