结论：是否会被认定为旷工以及是否影响赔偿款，取决于具体情况，包括单位规章制度、工伤认定情况以及病假条的开具要求等。以下从不同角度进行分析：
一、关于是否会被认定为旷工
单位规章制度：
- 如果单位规章制度中明确规定，员工因工伤需要休息时，必须提供病假条作为请假依据，否则将视为旷工，那么在这种情况下，如果员工未开具病假条，单位可能会依据规章制度将其视为旷工。
- 如果单位规章制度中未明确规定此类情形，或者规定较为模糊，那么单位在认定旷工时可能会面临一定的法律风险。
工伤认定情况：
- 如果员工已经经过工伤认定，且工伤认定机构已经出具了工伤认定决定书，明确了员工因工伤需要休息治疗，那么在这种情况下，即使员工未开具病假条，单位也不应轻易将其视为旷工。因为工伤认定决定书本身就具有证明员工因工伤需要休息的法律效力。
- 如果员工尚未进行工伤认定，或者工伤认定结果尚未出具，那么单位在认定旷工时可能会更加谨慎，因为此时员工是否因工伤需要休息尚存在不确定性。
病假条的开具要求：
- 病假条通常需要由医疗机构出具，并明确员工的病情、休息期限等信息。如果员工因工伤需要休息，但未能及时开具病假条，可能是因为医疗机构流程繁琐、医生未及时出具等原因。在这种情况下，员工应尽快与医疗机构沟通，开具病假条，并向单位说明情况。
- 如果员工故意不开具病假条，或者无正当理由拒绝开具病假条，那么单位可能会依据规章制度将其视为旷工。
二、关于是否影响赔偿款
工伤赔偿与旷工的关系：
- 工伤赔偿是基于员工因工伤遭受的损失而进行的赔偿，与员工是否旷工无直接关系。但是，如果员工因旷工被单位解除劳动合同，且该解除行为被认定为合法，那么员工可能会失去继续享受工伤保险待遇的资格，从而影响后续的工伤赔偿。
- 另外，如果员工因旷工导致单位对其产生不良印象，可能会在工伤赔偿的协商过程中处于不利地位，但这并非法律上的直接影响。
病假条对工伤赔偿的影响：
- 病假条是证明员工因工伤需要休息的重要证据之一。如果员工未能开具病假条，可能会影响单位对其工伤情况的认可程度，从而在工伤赔偿的协商或诉讼过程中产生不利影响。
- 但是，如果员工已经经过工伤认定，且工伤认定机构已经出具了工伤认定决定书，那么病假条的缺失可能不会对工伤赔偿产生决定性影响。因为工伤认定决定书本身就具有证明员工因工伤需要休息的法律效力。
三、建议
- 及时开具病假条：员工因工伤需要休息时，应尽快与医疗机构沟通，开具病假条，并向单位说明情况。如果因特殊原因无法及时开具病假条，应尽快向单位说明原因，并承诺尽快补开。
- 了解单位规章制度：员工应了解单位的规章制度，特别是关于工伤请假和旷工认定的相关规定。如果单位规章制度中存在不合理或违法的内容，员工可以向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
- 积极进行工伤认定：员工因工伤遭受损失时，应积极进行工伤认定，以便及时享受工伤保险待遇和获得工伤赔偿。如果单位拒绝为员工进行工伤认定或拖延认定时间，员工可以向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
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