核心结论：员工请顶班拿差价的行为可能涉及违反公司规章制度、劳动纪律甚至构成职务侵占等违法行为，公司应根据具体情况采取相应措施，包括但不限于教育纠正、纪律处分、追偿损失及法律追责。以下从不同角度详细分析：
从公司规章制度角度
- 制度依据：公司通常会在员工手册或相关规章制度中明确规定员工的工作职责、行为规范以及禁止性行为，如禁止私自安排他人顶班、禁止利用职务之便谋取私利等。若员工请顶班拿差价的行为违反了这些规定，公司有权依据制度对其进行处理。
- 处理措施：公司可以先对员工进行教育，指出其行为的错误性和可能带来的后果，要求其立即停止此类行为并退还非法所得。若员工拒不改正，公司可以根据规章制度的规定给予相应的纪律处分，如警告、记过、降职、解雇等。
从劳动纪律角度
- 纪律要求：劳动纪律是劳动者在劳动过程中必须遵守的行为准则，包括按时上下班、认真履行工作职责、不得擅自离岗等。员工请顶班拿差价的行为显然违反了劳动纪律，影响了正常的工作秩序。
- 处理方式：公司可以依据劳动纪律的相关规定，对员工进行批评教育，并要求其书面检讨。对于情节严重的，如多次违反、造成较大损失或不良影响的，公司可以解除劳动合同，且无需支付经济补偿。
从法律责任角度
- 职务侵占：如果员工利用职务上的便利，将本应由公司支付给顶班人员的报酬据为己有，且数额较大，可能构成职务侵占罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，职务侵占罪是指公司、企业或者其他单位的人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的行为。
- 民事赔偿：即使员工的行为不构成犯罪，但如果给公司造成了经济损失，如因顶班人员不熟悉工作导致生产事故、客户投诉等，公司有权要求员工承担民事赔偿责任。
- 处理建议：公司应收集相关证据，如员工安排顶班的记录、差价支付的凭证、公司损失的证明等，以便在需要时向公安机关报案或向法院提起诉讼。
从预防与管理角度
- 加强制度建设：公司应完善员工手册和规章制度，明确禁止请顶班拿差价等行为，并规定相应的处罚措施。
- 加强监督与管理：公司应加强对员工工作行为的监督与管理，及时发现并纠正违规行为。可以通过定期检查、员工举报等方式来发现潜在的问题。
- 加强培训与教育：公司应定期对员工进行法律法规和职业道德的培训与教育，提高员工的法律意识和职业道德水平，减少违规行为的发生。