关于年病假天数在医疗期内的职工的年终奖励是否可以扣除的问题，结论前置如下：
- 若单位规章制度中有明确且合法合理的规定：单位可以依据规定扣除年终奖，但需确保规定已履行民主程序并公示，且扣除比例合理。
- 若单位规章制度中无明确规定或规定不合理：单位不能仅以职工请病假为由扣除年终奖，否则可能构成违法。
详细分析如下：
一、单位规章制度的作用与限制
根据《中华人民共和国劳动法》第四条和第四十七条，用人单位有权依法制定包括年终奖发放在内的各项规章制度，并自主确定工资分配方式和水平。然而，这些规章制度必须合法、合规，不能违反国家法律法规和劳动政策，且需经过民主程序制定（如职工代表大会讨论通过），并向劳动者公示告知。
- 有明确规定时：如果单位在劳动合同、员工手册或其他合法有效的规章制度中明确规定，员工请病假达到一定天数或频次会影响年终奖的发放，并且这些规定已经履行了民主程序并已向员工公示，那么在符合该规定的情形下，单位扣除年终奖可能是合理合法的。但扣除比例应当合理，不能过于苛刻。
- 无明确规定时：如果规章制度中无相关规定或规定不明确，用人单位不得随意扣除员工年终奖。年终奖的发放应遵循公平合理、诚实信用的原则，考虑员工的实际绩效和贡献。
二、病假与年终奖的关系
年终奖是对员工一年工作业绩的肯定，通常基于绩效考核结果发放。员工请病假期间，可能无法正常履行工作职责，从而影响工作业绩和绩效考核结果。然而，这并不意味着单位可以随意扣除年终奖。
- 合理性考量：即便规章制度中有相关规定，用人单位在扣除年终奖时也应遵循合理性原则。对于因严重疾病需要长时间治疗休息的员工，用人单位应给予适当照顾，避免过度扣除。
- 法律底线：根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，用人单位不得克扣或无故拖欠员工工资，包括年终奖。扣除年终奖必须有明确的规章制度依据，且金额必须合理。
三、医疗期内职工的特殊保护
对于处于医疗期内的职工，根据相关法律法规，用人单位在支付病假工资或疾病救济费的同时，不得大幅不合理地扣除年终奖。医疗期是职工因患病或非因工负伤停止工作治病休息不得解除劳动合同的时限，期间职工享有相应的工资福利待遇。
四、劳动者权益保护与维权途径
如果劳动者认为单位扣除年终奖的行为不合理不合法，可以先与单位进行协商沟通；若协商不成，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。同时，劳动者也应了解自己的权利和义务，遵守单位的规章制度，避免不必要的纠纷。
实际应用建议：
- 对于单位而言：建议在制定规章制度时明确年终奖的发放条件和扣除标准，并确保这些内容合法、合理、透明。同时，应加强对员工的宣传和培训，让员工了解并遵守相关规定。在扣除年终奖时，应遵循合理性原则，避免过度扣除。
- 对于劳动者而言：建议在请假前详细了解并遵守单位的规章制度中关于年终奖的规定。如果发现自己的权益受到侵害，应及时采取措施维护自己的合法权益，如与单位协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁等。
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