非标准工时未经过审批，法院一般会根据具体情况判决企业补办审批手续或认定相关工时制度无效，并可能要求企业支付加班费或承担其他法律责任。具体分析如下：

1. 补办审批手续的可能性：

   • 如果企业能够证明其实际实行的是非标准工时制度，且该制度符合法律法规的规定，只是未及时办理审批手续，法院可能会给予企业一定的期限来补办审批手续。
   • 在补办审批手续期间，企业应继续按照非标准工时制度支付员工工资，并确保员工的休息休假权益不受侵害。

2. 认定工时制度无效及法律责任：

   • 如果企业无法证明其实际实行的是非标准工时制度，或者该制度违反了法律法规的强制性规定，法院可能会认定该工时制度无效。
   • 在这种情况下，企业应按照标准工时制度（即每日工作8小时，每周工作40小时）来支付员工工资，并补发因实行非标准工时制度而少发的加班费。
   • 如果企业因实行非标准工时制度而侵犯了员工的休息休假权益，法院还可能要求企业承担相应的赔偿责任。

3. 具体案例中的考量因素：

   • 法院在判决时，会综合考虑企业的实际情况、员工的权益保护以及法律法规的规定。
   • 例如，如果企业因生产特点确实需要实行非标准工时制度，且已经与员工协商一致并签订了相关协议，但只是未办理审批手续，法院可能会倾向于支持企业补办审批手续。
   • 反之，如果企业未经员工同意擅自实行非标准工时制度，且未办理审批手续，法院则可能会认定该制度无效，并要求企业承担相应的法律责任。

建议：

• 企业应严格遵守法律法规的规定，及时办理非标准工时制度的审批手续，确保员工的权益得到保障。
• 如果企业因特殊原因未能及时办理审批手续，应尽快与员工协商并补办相关手续，以避免法律风险。
• 员工在发现企业实行非标准工时制度但未办理审批手续时，可以向劳动监察部门投诉或向法院提起诉讼，维护自己的合法权益。

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