针对您提出的“新劳动法下上班脑梗超过48小时后死亡，公司需要付哪些费用”的问题，这主要涉及到工伤认定及相应的赔偿问题。以下是我为您详细梳理的解答：
一、工伤认定的关键条件
根据《工伤保险条例》的相关规定，职工在工作时间和工作岗位上突发疾病死亡，或者在48小时之内经抢救无效死亡的，视同工伤。这是判断是否构成工伤的核心标准。对于您提到的情况，即员工在上班时突发脑梗且超过48小时后死亡，这通常不符合工伤认定的直接条件。
二、若构成工伤的赔偿项目（虽不符合当前情况，但为全面解答列出）
若员工的情况符合工伤认定标准，公司需支付以下费用：
丧葬补助金：按照统筹地区上年度职工月平均工资的6倍计算。
供养亲属抚恤金：根据员工生前工资的一定比例发放给由其提供主要生活来源且无劳动能力的亲属。具体比例为：配偶每月40%，其他亲属每人每月30%，孤寡老人或孤儿在上述基础上增加10%。所有亲属抚恤金总额不得超过员工生前工资。
一次性工亡补助金：按照上一年度全国城镇居民人均可支配收入的20倍计算。
三、不构成工伤时的补偿途径
由于您提到的情况（超过48小时后死亡）通常不符合工伤认定条件，因此公司需按照非因工死亡的待遇来处理。这可能包括：
丧葬补助费：具体金额需参照当地政策规定，一般是按照社会平均工资的一定倍数来计算。
供养直系亲属一次性救济金（或生活补助费）：这也是根据当地政策来确定的，旨在为员工的直系亲属提供一定的经济支持。
社保个人账户余额继承：员工的养老保险、医疗保险等个人账户中的余额及利息，可以由其家属继承。
商业保险理赔：如果员工购买了相关的商业保险（如意外险、寿险等），其家属还可以向保险公司申请赔付。
四、处理流程建议
了解当地政策：首先，建议您或员工家属咨询当地社保部门或劳动监察部门，了解具体的非因工死亡待遇政策和程序。
与公司协商：在了解政策后，可以与公司进行协商，就赔偿事宜达成一致意见。
寻求法律援助：如果协商无果，或者对政策理解有误，建议寻求专业律师的帮助，通过法律途径来维护自身权益。
综上所述，对于您提出的问题，由于员工在上班时突发脑梗且超过48小时后死亡，通常不符合工伤认定条件，因此公司需按照非因工死亡的待遇来处理。具体赔偿项目和标准需参照当地政策规定。希望这些解答能对您有所帮助。