劳动者与用人单位签订赔偿协议后，仍然可以主张工伤赔偿。这一结论基于以下法律背景和具体分析：

法定权利不受影响

申请工伤认定是受伤职工的法定权利，这一权利不因与用人单位签订了赔偿协议而丧失。根据《工伤保险条例》的相关规定，职工在发生事故伤害或被诊断、鉴定为职业病后，有权在规定的时限内向社会保险行政部门提出工伤认定申请。因此，无论是否已签订赔偿协议，劳动者都有权依法申请工伤认定，并据此主张工伤赔偿。

赔偿协议的性质与影响

赔偿协议是劳动者与用人单位之间就工伤赔偿事宜达成的民事协议。它虽然对双方具有一定的约束力，但并不能替代或剥夺劳动者的工伤认定权利和工伤赔偿请求权。赔偿协议的内容，如赔偿金额、责任划分等，可能因各种因素（如信息不对称、缺乏专业知识等）而存在不公平或不合理的情况。因此，劳动者在签订赔偿协议后，仍有权根据工伤认定的结果，评估是否需要进一步主张权益。

不同情形下的处理

1. 协议赔偿金额合理且自愿：

   • 如果赔偿协议是在合法、自愿、公平的基础上达成的，且赔偿金额基本涵盖了工伤职工应得的赔偿项目和金额，那么即使后续进行了工伤认定，也可能不会对已签订的赔偿协议产生实质性影响。但劳动者仍应保留好相关证据，以备不时之需。

2. 协议存在欺诈、胁迫或显失公平：

   • 如果赔偿协议是在用人单位欺诈、胁迫劳动者，或者协议内容显失公平的情况下签订的，那么劳动者申请工伤认定就显得尤为重要。一旦工伤认定结果确定，劳动者可以依据法定的工伤待遇标准，通过法律途径（如劳动争议仲裁、诉讼等）要求撤销或变更原赔偿协议，以确保自己的合法权益得到充分保障。

法律建议与注意事项

• 谨慎签订赔偿协议：在签订赔偿协议时，劳动者应充分了解自己的权益和法定的工伤待遇标准，避免因信息不对称或缺乏专业知识而做出不利的决定。如有必要，可以寻求专业律师的帮助，以确保协议内容的合法性、公平性和有效性。
• 及时申请工伤认定：无论是否已签订赔偿协议，劳动者都应在符合规定的时间内向相关部门提出工伤认定申请。这是维护自己合法权益的重要步骤。
• 保留好相关证据：在处理工伤赔偿事宜时，劳动者应保留好所有与工伤有关的证据，如医疗记录、事故报告、赔偿协议等。这些证据将在后续的法律程序中发挥重要作用。

综上所述，劳动者与用人单位签订赔偿协议后，仍然可以主张工伤赔偿。在处理此类问题时，应充分考虑赔偿协议的具体内容和签订情况，并根据实际情况采取相应的法律措施来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。