结论：在厂区内发生交通事故且被鉴定为工伤3级的情况下，工厂是否需要赔偿，主要取决于事故发生时员工是否在执行工作任务以及事故的性质和责任归属。以下分情况详细说明：
一、员工在执行工作任务时发生交通事故
工伤认定与赔偿：
- 根据《工伤保险条例》第十四条，若员工在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害，应认定为工伤。在您的情况下，若事故发生在厂区内且员工正在执行工作任务，那么该事故应被认定为工伤。
- 工伤3级属于较为严重的工伤等级，员工有权享受相应的工伤保险待遇，包括一次性伤残补助金、伤残津贴等。若工厂已为员工缴纳工伤保险，这些赔偿将主要由工伤保险基金支付；若未缴纳，则工厂需承担全部赔偿责任。
工厂责任：
- 除了工伤保险待遇外，如果事故是由于工厂的安全管理不善或设备故障等原因导致的，工厂还可能需承担额外的民事赔偿责任。
- 根据《中华人民共和国民法典》第一千一百九十一条，用人单位的工作人员因执行工作任务造成他人损害的，由用人单位承担侵权责任。虽然此条款主要针对造成他人损害的情况，但同理可推，若员工因执行工作任务自身受伤且非主要责任，工厂也应承担相应责任。
二、员工在非执行工作任务时发生交通事故
- 如果事故发生时员工并非在执行工作任务，而是因个人私事或违反工厂规定在厂区内活动，那么该事故通常不被认定为工伤。
- 在此情况下，工厂一般无需承担赔偿责任，除非能证明工厂对事故的发生存在过错（如厂区道路设计不合理、未设置安全警示标志等）。
三、特殊情况与建议
特殊情况：
- 如果事故涉及第三方责任（如其他车辆或行人），那么除了工伤保险待遇外，员工还有权向第三方追偿。
- 若工厂对事故的发生存在过错，如未提供安全的工作环境或未进行必要的安全培训，员工可能还有权要求工厂承担额外的赔偿责任。
建议：
- 及时申请工伤认定：员工应在事故发生后尽快向工厂或当地社保部门申请工伤认定，以便享受相应的工伤保险待遇。
- 收集证据：员工应收集与事故相关的证据，如现场照片、证人证言、医疗记录等，以支持自己的赔偿请求。
- 咨询专业律师：虽然我在此提供了基本的法律分析，但每个案件的具体情况都有所不同。因此，建议您在处理此类问题时直接向我咨询，以便获取更具体、更专业的法律建议。
总结：在厂区内发生交通事故且被鉴定为工伤3级的情况下，工厂是否需要赔偿取决于事故发生时员工是否在执行工作任务以及事故的性质和责任归属。若员工在执行工作任务时受伤且非主要责任，工厂应承担相应的赔偿责任；若员工在非执行工作任务时受伤或承担主要责任，工厂则可能无需赔偿。在处理此类问题时，建议您及时申请工伤认定、收集证据并直接向我咨询以获取更具体的法律建议。