结论：公司检查员工在食堂吃饭时的乙肝情况，一般是不合法的，除非存在特定法律允许的情形。

分析如下：

1. 从隐私权保护的角度：

   • 乙肝状况属于员工的个人隐私信息，受到法律的保护。根据《中华人民共和国民法典》中关于隐私权的规定，任何组织或者个人不得以刺探、侵扰、泄露、公开等方式侵害他人的隐私权。
   • 公司未经员工同意，擅自检查其乙肝情况，很可能构成对员工隐私权的侵犯。

2. 从就业歧视的角度：

   • 根据《中华人民共和国就业促进法》等相关法律法规，用人单位在招聘、录用、晋升等过程中，不得对劳动者进行就业歧视，包括基于乙肝状况的歧视。
   • 如果公司因为员工的乙肝状况而采取不公平的待遇，如拒绝录用、解雇、降薪等，这将构成就业歧视，是违法的。

3. 特定法律允许的情形：

   • 虽然一般情况下公司检查员工乙肝情况是不合法的，但也存在一些特定情形下法律允许或要求进行此类检查。例如，某些特定行业（如食品加工、医疗卫生等）可能因工作性质需要，对员工的健康状况有更高要求，但这也必须在法律允许的范围内，并遵循严格的程序和规定。
   • 即便是在这些特定情形下，公司也必须确保检查的合法性、必要性和合理性，并尊重员工的知情权和同意权。

建议：

• 对于员工：如果公司未经你同意擅自检查你的乙肝情况，或者因为你的乙肝状况而采取不公平的待遇，你可以向公司提出异议，并要求公司停止侵权行为。如果公司不予理会，你可以向劳动监察部门投诉，或者寻求法律援助，通过法律途径维护自己的合法权益。
• 对于公司：公司应该尊重员工的隐私权和就业权利，避免进行不必要的健康检查，特别是涉及个人隐私的检查。如果确实需要进行健康检查，应该确保检查的合法性、必要性和合理性，并遵循严格的程序和规定，同时尊重员工的知情权和同意权。

后续行动：

• 如果你作为员工遇到了此类问题，建议先与公司沟通，明确表达你的立场和诉求。
• 如果沟通无果，你可以收集相关证据，如公司检查的通知、你的乙肝检查报告（如果进行了检查）、公司的不公平待遇证明等，以便在需要时向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。

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