员工因配偶生育而请假期间，工资计算需根据请假性质及公司制度综合判断，具体分为以下几种情况：

1. 若员工申请的是法定陪产假
   根据《人口与计划生育条例》及地方性法规，男性员工在配偶生育期间通常享有7-15天陪产假（具体天数因地区而异，如北京为15天，上海为10天）。此期间工资应全额发放，视为正常出勤，用人单位不得扣减。若公司制度与法规冲突，以法规为准。

2. 若员工申请的是事假
   若员工超出法定陪产假天数继续请假，或公司未提供陪产假，员工申请事假时，工资计算需遵循公司制度。通常事假为无薪假，但公司可酌情发放部分补贴（非强制）。若公司制度未明确规定，建议与员工协商解决，避免劳动纠纷。

3. 若员工申请的是病假或其他假期
   若员工因配偶生育相关事宜（如配偶产后并发症需照顾）申请病假，需提供医疗机构证明，工资按病假工资标准发放（通常为当地最低工资的80%）。若申请其他假期（如年假），则按年假工资标准发放。

4. 公司制度与法律冲突时的处理
   若公司制度中关于陪产假或事假的规定低于法定标准（如陪产假天数不足、事假扣薪比例过高），员工有权要求公司按法律规定执行。公司拒不改正的，员工可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

建议：

• 公司应完善假期制度，明确陪产假、事假等工资计算标准，避免歧义；
  
• 员工请假前应与公司沟通假期性质，保留相关证明（如出生证明、医疗机构证明等）；
  
• 若发生纠纷，建议双方先协商，协商不成可通过劳动仲裁或诉讼解决。
  

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