公司拖欠工资，员工解除劳动合同后，公司补发工资仍需支付经济补偿金，但存在例外情况。

首先，根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位未及时足额支付劳动报酬，劳动者有权解除劳动合同，并可以要求用人单位支付经济补偿金。经济补偿金的具体计算方式通常依据劳动者在本单位的工作年限，每满一年支付一个月工资，六个月以上不满一年的按一年计算，不满六个月的支付半个月工资。

然而，也存在一些例外情况。如果用人单位只是偶尔拖欠工资，并且在劳动者提出异议后及时补发，且获得了劳动者的谅解，那么这种情况一般不被认定为“未及时足额支付劳动报酬”。在这种情况下，劳动者以此为由解除劳动合同并主张经济补偿金，可能得不到支持。

因此，具体是否需要支付经济补偿金，还需要结合实际情况来判断。如果公司确实存在长期或恶意拖欠工资的行为，那么员工在解除劳动合同后，即使公司后来补发了工资，也仍然有权要求公司支付经济补偿金。

总之，在处理这类问题时，建议员工先与公司进行协商，尝试通过友好沟通解决问题。如果协商无果，可以及时向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。同时，也建议公司在日常管理中加强财务管理，确保按时足额支付员工工资，避免不必要的法律纠纷。