结论：分包不认可总包是挂靠的情况下，是否构成事实合同关系，需根据具体情况判断，主要看双方是否实际履行了合同的主要义务，且这种履行是否基于双方的合意。以下从不同角度进行分析：
一、事实合同的构成要件
事实合同，是指当事人虽未通过书面形式、口头形式或者其他形式明确约定合同条款，但是一方已经实际履行了合同的主要义务，对方接受的，可以认定为合同成立。其构成要件主要包括：
- 一方实际履行了合同的主要义务：这要求一方已经按照合同通常的内容和要求，完成了其应承担的主要工作或提供了主要服务。
- 对方接受：对方对一方的履行行为表示认可，并接受了其履行所带来的利益。
二、分包与总包的关系对事实合同认定的影响
若分包与总包之间存在实际履行行为：
- 如果分包单位实际上已经按照总包的要求进行了施工，且总包单位也接受了分包单位的施工成果，那么即使双方没有签订书面的分包合同，也可以基于事实合同的关系来认定双方之间的权利义务。
- 在此情况下，分包不认可总包是挂靠，并不影响事实合同的成立。因为事实合同的认定主要基于实际履行行为，而非双方对合同性质的认知或声明。
若分包与总包之间不存在实际履行行为：
- 如果分包单位并未实际进行施工，或者总包单位并未接受分包单位的施工成果，那么双方之间就不存在事实合同关系。
- 在此情况下，无论分包是否认可总包是挂靠，都无法改变双方之间不存在合同关系的事实。
三、挂靠关系对事实合同认定的潜在影响
- 挂靠关系通常指的是一个不具备相应资质的单位或个人，通过挂靠在一个具备资质的单位名下，以该单位的名义从事经营活动。在建设工程领域，挂靠关系可能涉及违法分包、转包等违法行为。
- 如果分包与总包之间存在挂靠关系，且这种挂靠关系影响了双方实际履行合同的行为（例如，由于挂靠单位不具备相应资质，导致施工无法进行或施工质量不达标），那么这可能成为认定事实合同是否成立的一个考量因素。但并非决定性因素，因为事实合同的认定主要基于实际履行行为。
四、法律建议
- 收集证据：对于分包单位而言，如果希望证明与总包单位之间存在事实合同关系，应收集相关证据，如施工记录、验收报告、付款凭证等，以证明自己已经实际履行了合同的主要义务，且总包单位已经接受。
- 咨询专业律师：由于事实合同的认定涉及复杂的法律问题和证据规则，建议分包单位在遇到相关纠纷时，及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。
总结来说，分包不认可总包是挂靠的情况下，是否构成事实合同关系，需根据双方是否实际履行了合同的主要义务且对方是否接受来判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。