在施工合同无效，但工程验收合格且逾期竣工的情况下，不能主张违约责任，但可以依据过错原则要求赔偿损失，同时若工程验收合格，仍可参照合同约定折价补偿承包人。以下是对这一问题的详细分析：

一、违约责任与合同有效性的关系

违约责任的产生以合同的有效存在为前提。当施工合同被认定为无效时，该合同自始没有法律约束力，因此不存在基于有效合同约定的义务而违约的问题。所以，在合同无效的情形下，不能按照合同中关于违约责任的条款要求对方承担违约责任。例如，如果合同中约定了逾期竣工的违约金，但由于合同无效，这一条款也将失去法律效力，无法据此主张违约金。

二、无效合同的处理方式及过错赔偿责任

尽管不能主张违约责任，但根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事法律行为无效后，行为人因该行为取得的财产应当予以返还；不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。同时，有过错的一方应当赔偿对方由此所受到的损失；各方都有过错的，应当各自承担相应的责任。这意味着，在施工合同无效的情形下，如果一方对合同无效存在过错，并且这种过错给对方造成了损失，无过错方可以要求过错方承担损害赔偿责任。

举例说明：如果发包方明知承包方没有相应资质仍与其签订施工合同，导致合同无效并造成额外费用支出（如因承包方施工能力不足导致的工期延长、质量不达标等额外修复费用），此时承包方可依据过错程度要求发包方赔偿损失。

三、建设工程施工合同无效但工程验收合格的特殊处理

值得注意的是，《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》规定了一个特殊情形：即使建设工程施工合同无效，但如果建设工程经验收合格，仍然可以参照合同关于工程价款的约定折价补偿承包人。这一规定旨在平衡当事人之间的利益，保障实际施工人的权益。然而，这并不等同于违约责任，而是基于公平原则对工程价款的一种处理方式。

具体应用：在工程验收合格的情况下，即使合同无效，发包方仍需按照合同约定的价款支付给承包方。但这并不意味着承包方可以免除因逾期竣工可能产生的其他责任（如因逾期竣工给发包方造成的其他损失），只是不能按照合同中的违约责任条款主张违约金。

四、针对逾期竣工的额外考量

虽然合同无效导致违约责任条款失效，但若逾期竣工给发包方造成了实际损失（如租金损失、商业机会损失等），发包方仍可基于过错原则要求承包方赔偿。此时需证明：

1. 承包方对逾期竣工存在过错（如施工管理不善、未合理调配资源等）；
2. 发包方实际遭受了损失；
3. 损失与承包方的过错之间存在因果关系。

赔偿范围：通常限于直接损失，如因逾期导致的额外费用支出。若合同中有关于损失计算的约定（如每日按合同价款的万分之X计算），虽违约责任条款无效，但该约定可能作为损失计算的参考依据。

五、签订合同时的注意事项

为了避免合同无效带来的法律风险和经济损失，当事人在签订施工合同时应格外谨慎：

1. 确保合同内容合法合规：不违反法律法规的强制性规定，如资质要求、招投标程序等。
2. 仔细审查对方资质和履约能力：避免因对方不具备相应条件而导致合同无效。
3. 明确约定关键条款：如工程质量、工期、价款等，并严格遵守，以确保合同的顺利履行。

总结建议：在施工合同无效且工程验收合格但逾期竣工的情况下，当事人应首先确认合同无效的原因及各方过错程度，然后依据法律规定和实际情况主张权利。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。