公司注册资金由一百万变更到五万，这一变更本身通常不会直接影响您被辞退后的赔偿金额，但具体是否影响还需结合实际情况判断。以下从不同角度为您详细分析：
一、公司注册资金变更与赔偿的直接关系
公司注册资金的变更，主要是公司资本结构的调整，它反映了公司股东对公司承担责任的限额变化。然而，在员工被辞退的赔偿问题上，注册资金的变更并不直接决定赔偿的多少。根据《劳动合同法》的相关规定，员工被辞退后的赔偿主要依据的是员工在公司的工作年限、工资水平以及辞退的原因等因素。
二、可能影响赔偿的间接因素
公司经济状况：
- 虽然注册资金的减少不直接等同于公司经济状况的恶化，但在某些情况下，它可能反映了公司资金紧张或经营困难的现状。如果公司因此无法支付赔偿金，员工可能需要通过法律途径来维护自己的权益，如申请劳动仲裁或提起诉讼。
辞退原因与合法性：
- 辞退的原因和合法性是决定赔偿金额的关键因素。如果公司违法辞退员工，如无正当理由或未按照法定程序进行辞退，员工有权要求更高的赔偿，包括经济补偿金和赔偿金等。此时，公司注册资金的变更对赔偿金额的影响相对较小。
公司资产与负债情况：
- 注册资金的减少可能伴随着公司资产和负债的变化。如果公司资产不足以支付员工赔偿，即使注册资金较高，员工也可能面临难以获得全额赔偿的风险。反之，如果公司资产充足，即使注册资金减少，员工仍有可能获得全额赔偿。
三、实际操作中的建议
了解辞退原因和程序：
- 首先，您需要了解公司辞退您的具体原因和程序是否合法。如果公司存在违法辞退的行为，您可以依法要求更高的赔偿。
收集证据：
- 在与公司协商赔偿或提起法律诉讼时，您需要收集相关证据来支持自己的主张。这包括劳动合同、工资单、辞退通知等文件，以及可能存在的证人证言等。
咨询专业律师：
- 如果您对赔偿金额或辞退程序存在疑问，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议。作为专业律师，我可以根据您的具体情况，为您提供详细的法律分析和建议。
关注公司资产状况：
- 在必要时，您可以关注公司的资产状况，了解公司是否有足够的资产来支付您的赔偿。如果公司资产不足以支付赔偿，您可以考虑申请财产保全等措施来保障自己的权益。
总结来说，公司注册资金的变更本身通常不会直接影响您被辞退后的赔偿金额。但您需要关注公司辞退的原因和程序是否合法，以及公司的资产状况等因素。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。