在工厂倒闭且劳动者不满试用期的情况下，仅支付底薪通常是不合法的。以下是对此问题的详细分析：
法律法规依据及分析
经济补偿的支付：
- 根据《劳动合同法》第四十四条、第四十六条及第四十七条的规定，当工厂倒闭（即用人单位被依法宣告破产或被吊销营业执照、责令关闭、撤销等导致劳动合同终止）时，应当向劳动者支付经济补偿。
- 经济补偿的计算标准是按照劳动者在本单位工作的年限来确定，具体为每满一年支付一个月工资的标准。对于六个月以上不满一年的情况，按一年计算；不满六个月的，则支付半个月工资的经济补偿。此处的“月工资”指的是劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资，而非仅指底薪。
清偿顺序：
- 在工厂倒闭清算过程中，所欠职工的工资、医疗及伤残补助、抚恤费用，以及应当划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用等，均属于优先清偿的范畴，且处于第一清偿顺序。这意味着，在清算过程中，劳动者的工资和经济补偿应当得到优先保障。
试用期工资的特殊规定：
- 根据《劳动合同法》第二十条的规定，劳动者在试用期的工资不得低于本单位相同岗位最低档工资或者劳动合同约定工资的百分之八十，并不得低于用人单位所在地的最低工资标准。然而，这一规定并不意味着在工厂倒闭时，劳动者只能获得试用期工资或底薪。相反，劳动者仍有权获得按照其实际工作年限计算的经济补偿，且该经济补偿的计算基数应为劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。
劳动者应对措施
- 协商与投诉：劳动者首先可以尝试与工厂进行协商，要求支付全额工资（包括试用期工资与经济补偿）。若协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉，寻求行政救济。
- 劳动仲裁与诉讼：若投诉未能解决问题，劳动者还可以申请劳动仲裁，甚至提起诉讼来维护自己的合法权益。在仲裁或诉讼过程中，劳动者需要提供相关证据（如劳动合同、工资单、工厂倒闭的证明等）来支持自己的主张。
特殊情况考虑
- 工厂资金枯竭：若工厂确实因资金枯竭而无法支付全额工资和经济补偿，这虽可能在一定程度上被理解为无奈之举，但仍需遵循法律程序。劳动者可以关注工厂的清算进程，确保自己的权益在清算过程中得到尽可能的保护。
- 故意不支付：若工厂有资金却故意不支付全额工资和经济补偿，则明显违反法律规定。劳动者应坚决维护自己的合法权益，通过法律途径追究工厂的责任。
综上所述，工厂倒闭时仅支付劳动者底薪通常是不合法的。劳动者在遇到此类情况时，应积极采取措施维护自己的合法权益，并向我咨询以获取更具体的法律建议。