结论前置：食品生产企业未留样，主要违反了《中华人民共和国食品安全法》及相关实施条例和规范性文件的规定，将面临责令改正、警告、罚款、责令停产停业乃至吊销许可证等法律处罚。
一、违反的具体法律规定
《中华人民共和国食品安全法》的相关规定：
- 虽然《食品安全法》未直接详细规定食品留样制度，但第五十三条第二款要求食品经营企业建立食品进货查验记录制度，并保存相关凭证，这间接体现了对食品追溯和检测的要求，留样是这一制度的具体体现方式之一。
- 第一百二十六条明确规定，食品生产经营者若未按规定制定或实施生产经营过程控制要求，包括不留样行为，将由县级以上人民政府食品安全监督管理部门责令改正并给予警告；拒不改正的，将面临罚款、停产停业乃至吊销许可证的处罚。
《中华人民共和国食品安全法实施条例》的相关规定：
- 第七十条进一步明确了食品生产经营者的行为若不符合食品安全法或相关国家标准，将面临相应的法律处罚。不留样行为若被视为不符合这些规定，则将依据此条款进行处理。
配套法规和规范性文件的具体要求：
- 《餐饮服务食品安全操作规范》和《学校食品安全与营养健康管理规定》等配套法规和规范性文件对食品留样作出了具体规定，如学校食堂、集体用餐配送单位等每餐次的食品成品应留样，留样量应满足检验需要，并在专用冷藏设备中保存48小时以上。
二、处罚措施
根据不留样行为的严重程度和持续时间，食品生产经营者可能面临以下处罚措施：
- 责令改正与警告：这是初步的处罚措施，旨在促使食品生产经营者立即改正其不法行为。
- 罚款：对于拒不改正或情节较为严重的违法行为，相关部门将处以一定金额的罚款。具体罚款数额根据《食品安全法》第一百二十六条的规定，为五千元以上五万元以下。
- 责令停产停业：当违法行为情节严重时，相关部门有权责令食品生产经营者停产停业，以消除潜在的食品安全隐患。
- 吊销许可证：对于情节特别严重、已对食品安全构成严重威胁的违法行为，相关部门将吊销其食品经营许可证，彻底剥夺其从事食品生产经营的资格。
三、法律建议
- 建立完善的食品留样制度：食品生产企业应依据相关法律法规和食品安全管理的通常做法，建立完善的食品留样制度，确保每餐次的食品成品都进行留样，并满足留样量和留样时间的要求。
- 加强员工培训：企业应加强对员工的食品安全培训，提高员工对食品留样重要性的认识，确保留样工作的规范性和有效性。
- 积极配合监管部门的检查：企业应积极配合食品安全监管部门的检查，如实提供留样记录和相关凭证，以便监管部门及时准确地了解企业的食品安全状况。
四、实际案例与后果
在实际操作中，已有食品生产企业因未留样而受到法律处罚的案例。这些企业不仅面临了罚款等经济处罚，还因停产停业而遭受了巨大的经济损失和声誉损害。因此，食品生产企业应充分认识到食品留样的重要性，严格遵守相关法律法规和规范性文件的要求。
综上所述，食品生产企业未留样将面临严重的法律后果。作为食品生产企业，应严格遵守相关法律法规和规范性文件的要求，建立完善的食品留样制度，确保食品安全可追溯。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。