结论：公司让员工签整改协议后优化员工是否违法，需根据具体情况判断，主要看整改协议的内容、优化员工的理由及程序是否合法合规。以下从不同角度进行分析：

一、整改协议的内容合法性

1. 协议内容需合法：整改协议作为公司与员工之间的约定，其内容必须符合法律法规的规定，不得侵犯员工的合法权益。例如，协议中不能包含违法解除劳动合同、降低工资待遇等违法条款。
2. 协议需双方自愿：整改协议的签订应当基于双方自愿的原则，公司不得强迫员工签订。如果员工在签订协议时受到胁迫或欺诈，该协议可能被认定为无效。

二、优化员工的理由合法性

1. 合法理由：公司优化员工（通常指解除劳动合同）必须有合法的理由，如员工严重违反公司规章制度、不能胜任工作且经过培训或调岗后仍不能胜任、公司经营状况发生严重困难等。如果公司以不合法或不合理的原因优化员工，则可能构成违法解除劳动合同。
2. 证据充分：公司需要提供充分的证据证明其优化员工的理由是合法的。例如，如果公司以员工不能胜任工作为由解除劳动合同，需要提供员工不能胜任工作的证据以及经过培训或调岗后仍不能胜任的证据。

三、优化员工的程序合法性

1. 遵循法定程序：公司在优化员工时，必须遵循法定的程序。例如，根据《劳动合同法》的规定，公司解除劳动合同需要提前通知员工（或支付代通知金）、支付经济补偿金（在符合法定情形时）等。
2. 工会或职工代表意见：在某些情况下，公司解除劳动合同还需要听取工会或职工代表的意见。如果公司未遵循法定程序或未听取工会或职工代表的意见，则可能构成违法解除劳动合同。

四、可能面临的法律后果

1. 违法解除劳动合同的赔偿：如果公司违法解除劳动合同，员工有权要求公司支付赔偿金。赔偿金的计算标准通常为经济补偿金的两倍。
2. 恢复劳动关系：在某些情况下，员工还可以要求公司恢复劳动关系，即继续履行劳动合同。

五、建议

1. 审查整改协议：员工在签订整改协议前，应仔细审查协议内容，确保协议内容合法合规且符合自身利益。
2. 咨询专业律师：如果员工对公司优化员工的合法性存在疑问，建议咨询专业律师以获取更详细的法律意见。
3. 保留证据：员工应保留与整改协议和优化员工相关的所有证据，以便在必要时维护自己的合法权益。

举例：假设公司以员工不能胜任工作为由要求员工签订整改协议，并在协议中约定如果员工在一定期限内仍不能胜任工作，则公司有权解除劳动合同。如果公司在签订协议时未提供员工不能胜任工作的证据，且在解除劳动合同时未遵循法定程序（如未提前通知员工或未支付经济补偿金），则公司的行为可能构成违法解除劳动合同。

总结：公司让员工签整改协议后优化员工是否违法，需根据整改协议的内容、优化员工的理由及程序是否合法合规来判断。如果员工对此存在疑问或认为公司的行为违法，建议咨询专业律师以获取更详细的法律意见。