针对您提出的“签订的宅基地协议超过20年怎么处理”的问题，这确实是一个涉及法律、历史背景及现实情况的综合性问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、明确核心原则
首先，需要明确的是，尽管宅基地协议签订时间超过20年，但处理此类纠纷时，我们仍需依据法律法规，结合历史背景和现实情况，采取合理合法的方式来解决。
二、诉讼时效与权属确认
诉讼时效：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，一般民事权利的诉讼时效期间为三年。但值得注意的是，不动产物权请求返还财产并不受此三年诉讼时效的限制。因此，如果宅基地纠纷主要涉及物权归属问题，即使协议签订超过20年，您仍有权依法主张自己的权利。
权属确认：
- 首要任务是明确宅基地的权属。您应查阅并保留好宅基地使用证、土地登记资料等权属证明文件。如果这些文件丢失或不明确，建议及时向当地土地管理部门查询或申请补办。
- 同时，了解并熟悉《中华人民共和国土地管理法》、《中华人民共和国物权法》以及地方性法规，确保您的权益主张有坚实的法律基础。
三、具体处理方式
协商解决：
- 协商是解决纠纷的首选方式。您可以与对方直接沟通，明确各自的诉求和争议焦点，尝试通过友好协商达成一致意见。这种方式成本低、效率高，且有助于维护邻里关系。
调解处理：
- 如果协商无果，您可以寻求村民委员会、乡（镇）人民政府等基层组织的调解。这些组织熟悉当地情况，具有一定的权威性，能够有效促进双方和解。
- 部分地区还设有专门的土地纠纷调解机构，配备专业调解人员，能更专业、有效地处理宅基地争议。
- 调解达成的协议具有法律效力，双方应自觉履行。
行政处理：
- 对于宅基地权属等争议，您还可以向县级以上人民政府土地管理部门申请处理。政府会依据相关法律法规和政策，对纠纷进行全面调查，并作出公正的处理决定。
- 如果您对政府部门的处理决定不服，可以在规定期限内申请行政复议或提起行政诉讼。
司法途径：
- 如果纠纷属于平等主体之间的民事权益争议，如宅基地使用权、相邻关系等，您可以直接向人民法院提起民事诉讼。法院会依据法律法规进行审理和判决。
- 需要注意的是，超过二十年的纠纷可能存在诉讼时效问题。如果对方提出时效抗辩，且不存在时效中止、中断的情形，您可能会面临败诉风险。但特殊情况下，法院可根据权利人的申请决定延长诉讼时效。
四、证据收集与法律支持
证据收集：
- 在处理宅基地纠纷过程中，证据收集至关重要。您应积极收集并保留相关证据，如宅基地使用证、建房审批手续、历史档案、证人证言等。这些证据将有助于您维护自己的合法权益。
法律支持：
- 在必要时，您可以聘请律师提供专业意见和诉讼策略。律师将帮助您分析案情、准备证据材料，并代表您参与调解、行政处理或司法诉讼等程序，增强解决问题的针对性和有效性。
五、保持冷静与理性
在处理宅基地纠纷时，请务必保持冷静和理性。尊重对方的权益，以和平、公正的方式解决问题。避免采取过激行为或非法手段，以免加剧矛盾或引发新的法律问题。
综上所述，处理签订的宅基地协议超过20年的问题需要综合考虑多个方面。通过明确权属、灵活运用各种处理方式、注重证据收集和法律运用，您可以有效解决纠纷并维护自己的合法权益。希望这些建议能对您有所帮助。