结论：交通肇事罪被判一缓二的情况下，若单位要保留公职以特殊情况审批，程序难度因单位性质、内部规定及具体案情而异，无法一概而论，但通常涉及多个环节和严格审查。以下从多个角度进行分析：

一、单位性质与内部规定的影响

1. 单位性质：不同性质的单位（如国有企业、事业单位、政府机关等）对于员工犯罪后的处理态度和政策可能存在差异。一些单位可能更加注重员工的个人品质和职业操守，对犯罪记录持较为严格的态度；而另一些单位则可能更加注重员工的工作能力和实际贡献，对犯罪记录采取相对宽容的态度。

2. 内部规定：各单位内部通常会有关于员工犯罪后如何处理的规章制度。这些规定可能涉及犯罪类型、刑罚种类、缓刑期限等多个方面。因此，在申请保留公职时，需要仔细研究并遵守单位的内部规定。

二、审批程序与审查要点

1. 提交申请：员工需要向单位提交保留公职的申请，并附上相关证明材料，如法院判决书、缓刑执行通知书等。

2. 初步审查：单位人事部门或相关部门会对申请进行初步审查，核实员工的犯罪记录、缓刑期限以及是否符合单位内部规定等。

3. 深入调查：对于初步审查通过的申请，单位可能会进行更深入的调查，包括了解员工的犯罪原因、悔罪表现、工作表现等。这一环节可能涉及与员工本人、同事、上级或相关部门的沟通。

4. 集体讨论与决策：在深入调查的基础上，单位可能会组织相关部门或领导进行集体讨论，根据员工的实际情况和单位的规定作出决策。决策结果可能包括保留公职、解除劳动合同或采取其他处理措施。

三、可能面临的挑战与困难

1. 社会舆论压力：员工犯罪后，单位可能面临来自社会舆论的压力。这种压力可能影响单位对员工保留公职的决策。

2. 内部规定限制：如果单位内部规定对员工犯罪后的处理有严格限制，如明确规定犯罪员工不得保留公职等，那么员工申请保留公职的难度将大大增加。

3. 证据收集与证明：员工需要提供充分的证据证明自己的悔罪表现、工作能力以及对单位的贡献等。这些证据的收集和证明可能面临一定困难。

四、建议与策略

1. 提前了解单位规定：在申请保留公职前，员工应提前了解并熟悉单位的内部规定和政策，确保自己的申请符合单位要求。

2. 积极表现悔罪态度：在缓刑期间，员工应积极表现悔罪态度，遵守法律法规和单位规定，努力工作并争取做出贡献。

3. 寻求专业帮助：如果员工在申请保留公职过程中遇到困难或疑问，可以寻求专业律师或相关机构的帮助，以更好地维护自己的合法权益。

最后，交通肇事罪被判一缓二后申请保留公职的程序难度因单位性质、内部规定及具体案情而异。如果你或你身边的人遇到此类问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议和帮助。