劳务派遣员工医疗期满后的经济补偿，原则上由劳务派遣单位承担，但具体责任分配需根据实际情况及派遣协议约定综合判断。以下从不同角度详细分析：

一、法律关系与责任主体

1. 劳务派遣单位与劳动者的关系
   根据《劳动合同法》第五十八条，劳务派遣单位是用人单位，与被派遣劳动者签订劳动合同，承担用人单位的全部义务，包括支付经济补偿。因此，医疗期满后，若劳动者因不能从事原工作或另行安排的工作而被解除劳动合同，经济补偿应由劳务派遣单位支付。

2. 用工单位与劳动者的关系
   用工单位仅与劳动者存在实际用工关系，不直接承担经济补偿责任。但若用工单位存在过错（如未提供必要劳动条件导致劳动者患病），可能需承担连带赔偿责任，但此情形与医疗期满后的经济补偿无直接关联。

二、经济补偿的支付条件与标准

1. 支付条件
   根据《劳动合同法》第四十条、第四十六条，医疗期满后，劳务派遣单位需满足以下条件之一方可解除劳动合同并支付经济补偿：

   • 劳动者不能从事原工作；
     
   • 劳务派遣单位另行安排的工作后，劳动者仍不能从事。
     若劳务派遣单位未履行上述程序直接解除合同，可能构成违法解除，需支付赔偿金（经济补偿标准的2倍）。

2. 计算标准
   经济补偿按劳动者在劳务派遣单位的工作年限计算，每满1年支付1个月工资。具体公式为：
   经济补偿 = 工作年限 × 月工资
   其中，月工资为劳动者解除劳动合同前12个月的平均工资，且不低于当地最低工资标准。

三、派遣协议的约定影响

若劳务派遣单位与用工单位在派遣协议中明确约定，医疗期满后的经济补偿由用工单位承担，则需分情况处理：

1. 协议合法有效：若协议不违反法律强制性规定（如未免除劳务派遣单位法定责任），且劳动者知晓并同意，则用工单位可能需按协议承担部分或全部经济补偿。
   
2. 协议无效或部分无效：若协议排除劳务派遣单位责任、加重劳动者负担，或劳动者不知情，则相关条款无效，仍由劳务派遣单位承担经济补偿。

四、实务建议

1. 对劳动者：

   • 医疗期满前，及时与劳务派遣单位沟通工作安排；
     
   • 若被解除合同，要求劳务派遣单位出具书面通知，并核对经济补偿计算是否合法；
     
   • 如对补偿有异议，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

2. 对劳务派遣单位：

   • 在派遣协议中明确医疗期满后的责任分配，但需确保不违反法律规定；
     
   • 解除合同前，依法履行程序（如安排调岗、进行劳动能力鉴定），避免违法解除风险。

3. 对用工单位：

   • 审查派遣协议条款，避免约定违法内容；
     
   • 配合劳务派遣单位做好劳动者医疗期管理，降低纠纷风险。

如有进一步疑问，可直接向我咨询，我将结合具体案情提供专业分析。