结论：总承包人设立项目公司后，承包合同主体不必然转化为项目公司，是否转化需根据合同约定、实际履行情况及法律规定综合判断。以下从不同角度进行分析：

一、合同约定角度

1. 若合同明确约定主体可变更：若总承包人与发包人在承包合同中明确约定，总承包人有权设立项目公司，并将合同主体变更为项目公司，且该变更经发包人同意，那么在此情况下，承包合同主体可以转化为项目公司。这种约定通常是为了明确项目公司的权利义务，便于项目管理和风险隔离。
2. 若合同未约定或约定不明确：若承包合同中未对总承包人设立项目公司及合同主体变更事宜作出明确约定，或者约定不明确，那么总承包人不能单方面将合同主体变更为项目公司。此时，若总承包人试图通过设立项目公司来转移合同义务，可能构成违约行为，发包人有权要求总承包人继续履行合同或承担违约责任。

二、实际履行角度

1. 项目公司实际参与项目：即使承包合同中未明确约定主体变更事宜，但如果项目公司实际参与了项目的建设、管理等活动，且发包人对此未提出异议，甚至与项目公司进行了直接的业务往来，那么在实际操作中，可能会被视为合同主体已经发生了变更。然而，这种变更并不具有法律上的确定性，一旦发生纠纷，仍需根据合同约定和法律规定来判断合同主体的归属。
2. 总承包人仍履行合同义务：如果总承包人在设立项目公司后，仍然以自己的名义履行合同义务，如支付工程款、组织施工等，且发包人对此表示认可，那么在此情况下，合同主体并未发生变更。项目公司的设立可能仅是为了项目管理的便利或风险隔离的需要，而并不影响总承包人在合同中的法律地位。

三、法律规定角度

1. 合同相对性原则：根据合同法的相关规定，合同具有相对性，即合同只对缔约双方具有法律约束力。因此，在总承包人设立项目公司的情况下，除非合同明确约定或经发包人同意，否则总承包人不能单方面将合同义务转移给项目公司。
2. 债权债务概括转移：如果总承包人希望将合同主体变更为项目公司，且该变更不违反合同约定和法律规定，那么可以考虑通过债权债务概括转移的方式来实现。即总承包人与项目公司达成协议，将合同中的权利和义务一并转移给项目公司，并经发包人同意。然而，这种转移需要满足一定的法律条件，如通知发包人、取得发包人同意等。

建议：在实际操作中，总承包人应谨慎处理设立项目公司及合同主体变更事宜。如果确实需要变更合同主体，应事先与发包人进行充分沟通，并在合同中明确约定变更事宜及双方的权利义务。同时，总承包人还应确保项目公司的设立和运营符合相关法律法规的规定，以避免因合同主体变更而引发的法律纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。