结论前置：
- 若外地分公司不具有独立法人资格，则签订的外地分公司劳动合同，工资由总公司发放是合法的。
- 若外地分公司具有独立法人资格，则需严格按照劳动合同约定履行，若合同未约定总公司发工资，则总公司直接代发可能构成违法，但双方可协商变更合同或达成补充协议。
法律分析：
分公司法人资格的影响
不具有独立法人资格：
- 在此情况下，分公司作为总公司的附属机构，其民事责任由总公司承担。因此，分公司签订的劳动合同，总公司有权也有责任进行履行，这包括工资的发放。这种操作在法律上是允许的，不违反任何强制性规定。
- 例如，若某公司在外地设立了一个不具有独立法人资格的分公司，并招聘了员工，那么这些员工的工资由总公司发放是合理的，也是合法的。
具有独立法人资格：
- 若分公司具备独立法人资格，则其应独立承担责任，包括合同履行和工资支付。此时，若劳动合同中未约定总公司代发工资，总公司直接代发分公司员工的工资可能构成对合同相对性原则的违反，从而引发法律纠纷。
- 例如，若某外地分公司具有独立法人资格，并与员工签订了劳动合同，约定工资由分公司发放，但实际操作中由总公司代发，且未取得员工同意或未变更合同，则可能构成违法。
合同约定的重要性
- 无论分公司是否具有独立法人资格，都应在劳动合同中明确工资发放的主体、方式及时间等关键条款。这不仅是保障劳动者合法权益的需要，也是避免潜在法律风险的重要措施。
- 对于总公司代发分公司工资的情况，更应在合同中明确约定，并向员工充分说明，以确保员工的知情权和同意权。例如，可以在劳动合同中增加一条：“经双方协商一致，员工的工资由总公司代发，发放时间为每月XX日。”
实际操作的合理性
- 在实际操作中，总公司出于统一财务管理、资金调配等考虑，可能会选择代分公司发放工资。这种做法在分公司不具有独立法人资格的情况下是合理的，但也应遵循相关法律法规和合同约定。
- 若分公司具有独立法人资格，且合同未约定总公司代发工资，但双方希望变更工资发放方式，则应通过协商变更合同或达成补充协议的方式来解决。
风险防范与建议：
- 明确法人资格：在签订劳动合同前，应首先确认分公司的法人资格状态，以确保合同的有效性和合法性。
- 完善合同约定：在劳动合同中详细约定工资发放的主体、方式、时间及变更条件等关键条款，确保双方权益得到充分保障。
- 加强沟通说明：对于总公司代发分公司工资的情况，应向员工进行充分说明和解释，确保员工对此表示理解和接受。
- 及时咨询与调整：在实施涉及分公司与总公司之间财务或人事管理的重大决策时，若存在疑问或不确定之处，应及时向我咨询，以降低法律风险并保障公司利益。
如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我提问。