结论：公司是否可以将单双轮休且包含加班工资的制度改为双休制度，取决于多种因素，包括劳动合同的约定、公司规章制度、员工同意情况以及是否符合法律法规等。以下从不同角度进行分析：
一、劳动合同与规章制度的角度
劳动合同约定：
- 如果劳动合同中明确规定了员工的工作时间和休息休假制度，包括单双轮休和加班工资的支付方式，那么公司要改变这一制度，需要与员工协商一致，并修改劳动合同。
- 若劳动合同未明确规定，但公司规章制度中有相关规定，且员工已签字确认，公司同样需要遵循规章制度变更的合法程序，即与员工协商或通过民主程序修改规章制度。
公司规章制度：
- 公司规章制度是公司内部管理的重要依据，但必须符合法律法规的规定。如果规章制度中关于工作时间和休息休假的规定与法律法规相冲突，那么这些规定是无效的。
- 公司在修改规章制度时，需要遵循民主程序，即与员工代表或全体员工协商，并听取他们的意见。修改后的规章制度需要公示或告知员工，以确保员工知晓并同意。
二、员工同意与法律法规的角度
员工同意：
- 改变工作时间和休息休假制度，直接影响到员工的切身利益。因此，公司需要与员工进行充分沟通，并取得员工的同意。
- 如果员工不同意改变制度，公司不能单方面强制执行。否则，可能构成违法解除劳动合同或侵犯员工权益，需要承担相应的法律责任。
法律法规：
- 根据《中华人民共和国劳动法》等相关法律法规，员工有权享受休息休假的权利。公司安排员工加班需要支付加班工资，且加班时间受到严格限制。
- 如果公司要将单双轮休且包含加班工资的制度改为双休制度，需要确保这一改变不会违反法律法规的规定，如不会导致员工加班时间过长、加班工资支付不足等问题。
三、实际操作与建议
评估与规划：
- 公司在考虑改变工作时间和休息休假制度前，应进行全面评估，包括员工意见、公司运营需求、法律法规要求等。
- 制定详细的改变计划，包括改变的时间、方式、步骤等，并确保计划符合法律法规和公司规章制度的要求。
沟通与协商：
- 与员工进行充分沟通，解释改变制度的原因、目的和好处，听取员工的意见和建议。
- 尝试与员工达成一致意见，如果无法达成一致，可以考虑通过民主程序或法律途径解决。
法律合规：
- 在改变制度过程中，确保所有操作都符合法律法规的要求，避免违法违规行为。
- 如果对法律法规不熟悉或存在疑问，建议咨询专业律师或法律机构，以确保改变制度的合法性和有效性。
总结来说，公司要将单双轮休且包含加班工资的制度改为双休制度，需要综合考虑劳动合同、公司规章制度、员工同意以及法律法规等多方面因素。在改变制度前，应进行全面评估、与员工充分沟通、确保法律合规，并制定详细的改变计划。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。