双方因购房纠纷达成的协议，在符合法定条件的情况下是有效的。以下从多个角度为您详细分析：

一、协议有效的基本条件

1. 双方意思表示真实：协议必须是双方真实意愿的表达，不存在欺诈、胁迫等情形。如果一方在签订协议时受到欺诈或胁迫，那么该协议可能因意思表示不真实而被认定为无效或可撤销。

2. 协议内容合法：协议内容必须符合法律法规的规定，不得违反公序良俗。例如，协议中不能包含非法转让房产、逃避税收等违法内容。

3. 协议形式合法：根据《民法典》的相关规定，某些类型的合同需要采用书面形式。对于购房纠纷达成的协议，虽然法律没有明确规定必须采用书面形式，但为了保障双方权益，建议采用书面形式，并明确约定双方的权利和义务。

二、协议可能无效的情形

1. 无民事行为能力人签订的协议：如果一方是无民事行为能力人（如未成年人、精神病人等），那么其签订的协议可能因缺乏民事行为能力而被认定为无效。

2. 恶意串通损害他人利益的协议：如果双方恶意串通，损害国家、集体或第三人的利益，那么该协议将被认定为无效。

3. 以合法形式掩盖非法目的的协议：如果双方以签订协议的形式掩盖非法目的（如洗钱、逃税等），那么该协议也将被认定为无效。

三、协议效力争议的解决方式

1. 协商：如果双方对协议的效力存在争议，首先可以尝试通过协商的方式解决。双方可以重新审视协议内容，就争议点进行充分沟通，寻求共识。

2. 调解：如果协商无果，双方可以寻求第三方调解机构的帮助。调解机构可以协助双方梳理争议焦点，提出调解方案，促使双方达成和解。

3. 诉讼或仲裁：如果调解也无法解决争议，双方可以选择通过诉讼或仲裁的方式解决。在诉讼或仲裁过程中，法院或仲裁机构将依法对协议的效力进行审查，并作出裁决。

四、法律建议

1. 签订协议前充分沟通：在签订购房纠纷协议前，双方应充分沟通，明确各自的需求和期望，确保协议内容真实、合法、有效。

2. 咨询专业律师：由于购房纠纷涉及的法律问题较为复杂，建议双方在签订协议前咨询专业律师的意见。律师可以协助双方审查协议内容，提供法律建议，确保协议的合法性和有效性。

3. 保留相关证据：在签订协议过程中，双方应保留好相关证据（如聊天记录、转账记录等），以便在发生争议时能够证明自己的主张。

如果您在购房纠纷协议方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。