针对工程施工合同不认可造价鉴定结果的情况，核心处理方式需分情况讨论，具体如下：

1. 若合同明确约定了造价鉴定程序及争议解决方式
   首先需严格审查合同条款，例如是否约定了“以第三方鉴定结果为最终结算依据”“鉴定机构选定方式”或“争议解决条款”（如仲裁或诉讼）。若合同已明确约定，则需按约定程序推进：

   • 若约定以鉴定结果为准，但一方不认可，可依据《民事诉讼法》第85条或《仲裁法》第45条，在诉讼/仲裁中申请重新鉴定（需符合法定条件，如鉴定机构资质瑕疵、程序违法等）；
     
   • 若约定争议解决方式为仲裁，则需向合同约定的仲裁机构申请仲裁，仲裁庭有权委托鉴定或直接认定造价。
     

2. 若合同未明确约定造价鉴定程序
   此时需依据《民法典》合同编及《建设工程司法解释（一）》处理：

   • 协商阶段：双方可共同委托第三方机构重新鉴定，或协商确定造价（需留存书面协议）；
     
   • 诉讼/仲裁阶段：若协商不成，可向法院起诉或申请仲裁，由法院/仲裁庭委托鉴定机构进行造价鉴定。此时需注意：
     
     • 鉴定机构需具备相应资质（如工程造价咨询企业甲级资质）；
       
     • 鉴定范围需明确（如仅争议部分或全部工程）；
       
     • 鉴定材料需经双方质证（如施工图纸、变更签证、材料价格等）；
       
     • 若一方对鉴定结果有异议，可在收到鉴定书后10日内提出书面异议，法院/仲裁庭将要求鉴定人出庭说明或补充鉴定。
       

3. 若一方单方委托鉴定且另一方不认可
   单方委托的鉴定结果通常不被对方认可，此时需结合《民事证据规定》第41条处理：

   • 若对方未提出足以反驳的证据（如鉴定机构无资质、鉴定程序违法等），法院可能采纳该鉴定结果；
     
   • 若对方提出有效反驳，法院可能要求重新鉴定或委托其他机构鉴定。
     

建议行动步骤：

1. 立即审查合同条款，明确约定内容；
   
2. 收集施工过程中的全部证据（如签证、变更单、材料采购合同等）；
   
3. 若需重新鉴定，优先选择双方共同委托或法院/仲裁庭委托；
   
4. 若进入诉讼/仲裁，及时申请鉴定人出庭，确保鉴定程序合法。
   

如有进一步疑问或需具体操作指导，可直接向我咨询，我将结合您的合同条款及案件细节提供针对性建议。