在员工遭遇用人单位违规辞退，并申请劳动仲裁要求继续履行合同的情况下，关于仲裁诉讼期间工资的发放问题，我们可以从以下几个方面进行详细分析：
一、裁决恢复劳动关系的情况
适用情形：
- 当员工有继续履行劳动合同的意愿，且客观上具备继续履行的条件（如原工作岗位依然存在，企业未关闭相应业务部门，岗位未被他人替代等）时，仲裁委倾向于裁决恢复劳动关系。
工资发放：
- 若裁决恢复劳动关系，自违法解除之日起至实际恢复劳动关系期间，用人单位需按员工正常出勤的工资标准支付工资及福利待遇。这意味着，员工在仲裁诉讼期间，虽然可能未实际到岗工作，但因其被违法辞退，用人单位仍需支付其应得的工资。
法律依据：
- 《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规明确规定了劳动合同的恢复条件及执行方式，包括在此期间工资的支付标准。
二、裁决支付赔偿金的情况
适用情形：
- 若员工不要求恢复劳动关系，或劳动合同因客观原因无法继续履行（如岗位被替代、企业撤销该岗位等），仲裁委将裁决用人单位支付赔偿金。
工资与赔偿金的关系：
- 在此情况下，仲裁诉讼期间不再涉及工资的发放问题，而是转为支付赔偿金。赔偿金为经济补偿标准的二倍，经济补偿根据员工在本单位工作的年限计算。
赔偿金计算标准：
- 经济补偿按劳动者在本单位工作年限，每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资。月工资指劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。若劳动者月工资高于当地上年度职工月平均工资三倍的，赔偿金标准按职工月平均工资三倍的数额支付，最高不超过十二年。
三、其他可能的情况及处理
拖欠工资及加班费：
- 若用人单位在违法辞退过程中还存在拖欠工资、加班费等行为，仲裁委将裁决用人单位支付相应的拖欠金额。这包括仲裁诉讼期间可能存在的拖欠工资问题，但通常是在裁决恢复劳动关系或支付赔偿金的同时，一并处理此类拖欠问题。
出具证明及办理手续：
- 无论裁决恢复劳动关系还是支付赔偿金，用人单位都应在解除或终止劳动合同时出具证明，并在十五日内为员工办理档案和社会保险关系转移手续。这是用人单位的法定义务，与工资发放问题相对独立。
四、建议与总结
- 员工建议：在遭遇违法辞退时，员工应充分了解自身权益和法律规定，积极准备证据材料（如考勤记录、工资条、劳动合同等），通过劳动仲裁途径寻求合法救济。同时，员工也可以考虑在仲裁过程中或之后，根据裁决结果向人民法院提起诉讼，以进一步维护自身合法权益。
- 用人单位建议：用人单位应严格遵守劳动法律法规，避免违法辞退行为的发生。在辞退员工时，应确保符合法律法规的规定，并妥善处理与员工的工资、赔偿金等相关问题，以避免不必要的法律纠纷和损失。
综上所述，在用人单位违规辞退员工并申请劳动仲裁要求继续履行合同的情况下，仲裁诉讼期间工资的发放问题主要取决于仲裁委的裁决结果。若裁决恢复劳动关系，则用人单位需按正常标准支付工资；若裁决支付赔偿金，则不再涉及工资发放问题。