结论：针对您父亲生前小脑萎缩存款被同居女友转走并用于偿还她儿子债务的情况，您可以通过法律途径追回被转走的存款，并可能追究同居女友的法律责任。以下是从不同角度的详细分析：
一、法律关系分析
存款归属问题：
- 如果存款属于您父亲的个人财产，那么同居女友无权擅自转走。即使他们存在同居关系，同居女友也不享有对存款的支配权。
- 如果存款是您父亲与同居女友的共同财产（例如，存款中有部分是同居女友的出资或共同劳动所得），那么同居女友的转走行为可能构成对共同财产的侵害，但具体需根据实际情况和证据来判断。
转走存款的行为性质：
- 同居女友未经您父亲或您（作为法定继承人）的同意，擅自转走存款，可能构成盗窃或侵占行为。
- 如果同居女友利用您父亲小脑萎缩、无法表达真实意愿的情况，通过欺骗、胁迫等手段转走存款，还可能构成诈骗或抢劫行为（具体需根据实际情况和证据来判断）。
偿还债务的合法性：
- 即使同居女友转走存款后用于偿还她儿子的债务，这一行为本身并不改变转走存款的非法性。
- 除非她儿子对这笔债务有合法的债权，且同居女友的转走行为得到了您父亲或您的同意（这在实际情况下几乎不可能），否则偿还债务的行为不能成为转走存款的合法理由。
二、法律建议
收集证据：
- 收集所有能够证明存款属于您父亲个人财产的证据，如银行流水、存款凭证、遗嘱等。
- 收集同居女友转走存款的证据，如转账记录、银行交易明细、证人证言等。
- 如果可能，收集同居女友利用您父亲小脑萎缩情况转走存款的证据，如医疗记录、证人证言等。
报警处理：
- 如果您认为同居女友的行为构成盗窃、侵占、诈骗或抢劫等犯罪行为，可以向公安机关报案，要求追究她的刑事责任。
- 公安机关在调查过程中，会收集相关证据，并根据证据情况决定是否立案侦查。
提起民事诉讼：
- 如果您希望追回被转走的存款，可以向法院提起民事诉讼，要求同居女友返还存款并赔偿损失。
- 在诉讼过程中，您需要提供充分的证据证明存款的归属、转走行为的存在以及损失的大小。
- 法院会根据证据情况，判决同居女友返还存款并赔偿相应的损失。
考虑继承问题：
- 如果您父亲已经去世，且没有留下遗嘱，那么他的存款将按照法定继承顺序进行分配。
- 在这种情况下，您作为法定继承人之一，有权要求参与分配存款，并追回被同居女友转走的部分。
三、可能面临的法律后果
同居女友的法律责任：
- 如果同居女友的行为被认定为犯罪行为，她可能面临刑事处罚，如有期徒刑、拘役或罚金等。
- 如果同居女友的行为被认定为民事侵权行为，她可能需要承担民事责任，如返还存款、赔偿损失等。
您的权益保障：
- 通过法律途径追回被转走的存款后，您的财产权益将得到保障。
- 如果同居女友的行为给您造成了其他损失（如精神损害、时间成本等），您还可以要求她进行相应的赔偿。
最后，我建议您尽快采取行动，收集证据并咨询专业律师（即我本人，杨甜律师，专注于法律顾问、债权债务领域），以便更好地维护您的合法权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。