针对您提出的“员工已休年假后又休病假3个月，年休假怎么算”的问题，以下是根据《职工带薪年休假条例》及相关劳动法规，结合企业实际操作给出的详细解答：
一、年假与病假的基本规定
年假规定：
- 职工累计工作已满1年不满10年的，年休假5天；
- 已满10年不满20年的，年休假10天；
- 已满20年的，年休假15天。
- 国家法定休假日、休息日不计入年休假的假期。
病假规定：
- 企业职工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，根据实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予一定的医疗期，通常为3个月到24个月不等。
二、已休年假后休病假3个月对年假的影响
年假已休部分：
- 员工已经享受的年假天数，不会因后续休病假而退还或调整。年假是员工应享的权益，一旦享受即视为已使用。
病假对后续年假权益的影响：
- 根据规定，如果职工在一个年度内请病假累计达到一定天数，将不再享受当年的年休假。具体标准为：
- 累计工作满1年不满10年的职工，请病假累计2个月以上的，不再享受当年年休假；
- 累计工作满10年不满20年的职工，请病假累计3个月以上的，不再享受当年年休假；
- 累计工作满20年以上的职工，请病假累计4个月以上的，不再享受当年年休假。
- 在您的情况下，员工已休年假后又休病假3个月，且假设其累计工作年限在10年至20年之间，那么该员工将不再享受当年的剩余年休假（如果有的话）。
年假与病假同时休的特殊情况处理（虽您的情况是先休年假后休病假，但此点为补充说明）：
- 若员工在休年假期间因病需要休病假，应优先按病假处理。已休的年假部分，如因病假无法继续，视为已使用。病假可能影响当年剩余年假的享受，具体依据上述病假累计影响年假权益的规定。
三、后续病假待遇
医疗期计算：
- 病假天数会累计到医疗期计算中，只要不超过规定的医疗期，员工可享受病假工资待遇。
病假工资支付：
- 病假工资通常按照员工的基本工资或一定比例支付，具体计算基数和比例因地区、企业规定而异，但不得低于当地最低工资标准的80%。
四、建议与注意事项
企业方面：
- 制定明确的规章制度，规定年假期间休病假的处理方式，包括请假程序、证明材料要求、工资计算方法等。
- 与员工进行充分沟通，了解病情和请假需求，并做好相关记录，以确保休假安排的合法性和合理性。
员工方面：
- 充分了解相关规定，避免不必要的权益损失。
- 合理安排休假计划，确保既能充分休息又能保障合法权益。
综上所述，员工在已休年假后又休病假3个月的情况下，其当年的年假权益将受到一定影响，具体取决于其累计工作年限和病假天数。企业和员工都应充分了解相关法律法规和企业规章制度，以确保休假安排的合法性和合理性。