劳动监察部门对用人单位不缴纳农民工工资保证金立案的主要依据是相关法律法规中关于工资保证金制度的规定，以及用人单位违反该制度的具体情形。具体分析如下：

一、法律法规依据

1. 《保障农民工工资支付条例》

   • 第三十二条：施工总承包单位应当按照有关规定存储工资保证金，专项用于支付为所承包工程提供劳动的农民工被拖欠的工资。工资保证金可以用金融机构保函替代。有条件的地区还可探索引入工程担保公司保函或工程保证保险。
   • 第五十五条：规定了用人单位违反工资保证金制度等行为的法律责任，包括责令限期改正、处以罚款等。这为劳动监察部门对不缴纳工资保证金的用人单位进行立案查处提供了直接的法律依据。

2. 地方性法规或规章

   • 各地可能根据《保障农民工工资支付条例》的精神，结合本地实际情况，制定了更为具体的工资保证金管理办法或实施细则。这些地方性法规或规章同样会明确用人单位不缴纳工资保证金的法律责任，为劳动监察部门的立案查处提供补充依据。

二、用人单位违反工资保证金制度的具体情形

劳动监察部门在立案时，除了依据上述法律法规外，还需要确认用人单位存在不缴纳工资保证金的具体情形。这些情形可能包括但不限于：

• 未按规定存储工资保证金：用人单位未按照《保障农民工工资支付条例》或地方性法规的要求，存储足额的工资保证金。
• 以虚假保函替代工资保证金：用人单位虽然提供了保函，但保函内容虚假或不符合规定，无法起到保障农民工工资支付的作用。
• 拒不缴纳工资保证金：用人单位在劳动监察部门责令限期改正后，仍拒不缴纳工资保证金。

三、立案程序与后续处理

1. 立案程序：劳动监察部门在接到举报、投诉或自行发现用人单位存在不缴纳工资保证金等违法行为后，会依法进行立案调查。调查过程中，劳动监察部门会收集相关证据，包括用人单位的工资支付记录、保函情况、劳动监察部门的责令改正通知书等。
2. 后续处理：如果调查确认用人单位存在违法行为，劳动监察部门会依法责令其限期改正，并可能处以罚款等行政处罚。如果用人单位拒不改正或情节严重，劳动监察部门还可以将案件移送公安机关，依法追究其刑事责任。

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