行政机关在收到举报后，超过法定立案期限后立案的，一般仍属于履行法定职责，但可能存在程序瑕疵或需承担相应法律后果。以下从不同角度进行分析：
一、从法定职责的履行角度
行政机关的法定职责是指法律、法规、规章等规范性文件明确规定的行政机关应当履行的职责和义务。在举报处理领域，行政机关通常负有在法定期限内对举报事项进行审查并决定是否立案的职责。如果行政机关在收到举报后，虽然超过了法定立案期限，但最终仍然进行了立案处理，从结果上看，它履行了对举报事项进行审查并作出处理的职责。然而，这种履行方式存在程序上的延迟，可能不符合法律对行政效率的要求。
二、从程序瑕疵与法律后果角度
程序瑕疵：行政机关超过法定立案期限后立案，首先构成程序上的瑕疵。程序正义是法治原则的重要组成部分，行政机关在履行职责时应当遵循法定程序，确保程序的公正、公开和高效。超过法定期限立案，可能损害了举报人的合法权益，如举报人可能因行政机关的延迟处理而遭受进一步的损失。
法律后果：对于行政机关超过法定立案期限后立案的行为，可能面临多种法律后果。一方面，如果举报人因此遭受了实际损失，可以依法向行政机关提出赔偿请求；另一方面，行政机关及其工作人员可能因违反法定程序而受到内部纪律处分或外部监督机构的问责。此外，如果该行为被认定为严重违反法定程序，还可能影响行政机关作出的具体行政行为的合法性，进而在行政复议或行政诉讼中被撤销或变更。
三、从特殊情况与例外角度
虽然一般情况下行政机关超过法定立案期限后立案构成程序瑕疵，但也存在一些特殊情况或例外。例如，如果行政机关在收到举报后，因不可抗力或其他正当理由无法在法定期限内立案，且能够提供充分证据证明其延迟立案的合理性，那么这种延迟可能不被视为违法。然而，这种情况下的例外需要严格把握，且行政机关应当承担举证责任。
四、建议与措施
加强程序意识：行政机关应当加强程序意识，严格遵守法定程序，确保在法定期限内对举报事项进行审查并作出处理决定。
完善内部监督机制：行政机关应当建立健全内部监督机制，对超过法定期限立案等程序瑕疵行为进行及时纠正和问责。
加强与举报人的沟通：行政机关在处理举报事项时，应当加强与举报人的沟通，及时告知处理进展和结果，保障举报人的知情权、参与权和监督权。
寻求法律救济：如果举报人认为行政机关超过法定期限立案的行为损害了其合法权益，可以依法向行政机关提出赔偿请求或申请行政复议、提起行政诉讼等法律救济途径。
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