经营性用地的土地使用权原则上不可以以协议方式出让，但在特定条件下存在例外情况。以下是对此问题的详细分析：
一、一般原则：经营性用地不得协议出让
根据《招标拍卖挂牌出让国有建设用地使用权规定》等相关法律法规，工业、商业、旅游、娱乐和商品住宅等经营性用地，以及同一宗地有两个以上意向用地者的，应当以招标、拍卖或者挂牌方式出让，不得以协议方式出让。这一规定旨在确保土地出让的公平性和竞争性，防止土地资源的浪费和滥用。
二、例外情况：特定条件下的协议出让
尽管经营性用地原则上不得协议出让，但在以下特定条件下，仍可能存在协议出让的情况：
非经营性用地转经营性用地：
- 若某地块原为非经营性用地（如公共设施、公益事业等），后因规划调整或政策变化需转为经营性用地，且该地块在供地计划公布后只有一个意向用地者，那么在符合相关规划和政策的前提下，可能通过协议方式出让。但这种情况较为特殊，且需经过严格的审批程序。
特殊项目或区域发展需求：
- 某些特殊项目或区域发展可能需要通过协议出让方式来满足特定的用地需求。例如，政府为了推动某地区的经济发展或产业升级，可能通过协议方式将特定地块出让给符合条件的投资者。但这种情况同样需要严格的审批和监管，以确保土地的合理利用和市场的公平竞争。
历史遗留问题处理：
- 在某些历史遗留问题中，可能存在因政策变化或规划调整等原因导致的土地使用权出让方式变更问题。对于这类问题，政府可能根据具体情况采取协议出让等方式进行妥善处理。但这种情况属于个案处理，不具有普遍性。
三、协议出让的限制与监管
即使存在上述例外情况，协议出让也受到严格的限制和监管：
价格评估与公示：
- 协议出让的最低价不得低于新增建设用地的土地有偿使用费、征地（拆迁）补偿费用以及按照国家规定应当缴纳的有关税费之和；有基准地价的地区，协议出让最低价不得低于出让地块所在级别基准地价的70%。同时，协议出让结果需在土地有形市场等指定场所或通过报纸、互联网等媒介向社会公布，接受社会监督。
审批程序：
- 协议出让需经过严格的审批程序，包括用地申请、审查与协商、拟定出让方案、方案报批、签订出让合同等环节。任何环节的疏漏或违规都可能导致协议出让无效或面临法律责任。
后续监管：
- 协议出让后，政府还需对土地使用者的开发利用行为进行后续监管，确保土地按照合同约定的用途和期限进行开发利用。若土地使用者擅自改变土地用途或违反其他合同条款，政府有权依法追究其法律责任。
四、法律建议
对于有意通过协议方式取得经营性用地使用权的投资者而言，应充分了解相关法律法规和政策规定，谨慎评估投资风险和法律后果。在符合相关规划和政策的前提下，积极与政府相关部门沟通协商，争取通过合法合规的方式取得土地使用权。同时，在签订土地使用权出让合同时，应仔细阅读合同条款，确保自身权益得到充分保障。
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