结论：超市收银员因与顾客发生矛盾被老板扣工资，一气之下辞职是可以的，但需谨慎考虑后续权益保障问题。以下从多个角度为你详细分析：
一、老板扣工资的合法性
- 合法扣工资的情形：
- 根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
- 如果收银员与顾客的矛盾是由于收银员自身的重大过失或故意行为导致的，且给超市造成了经济损失，那么老板在符合上述规定的情况下，可以扣除部分工资作为赔偿。
- 非法扣工资的情形：
- 如果收银员与顾客的矛盾并非由于其自身原因造成，或者虽然有一定责任但并未给超市造成实际经济损失，或者老板扣除的工资超过了法定比例，那么老板的行为就属于非法克扣工资。
- 在这种情况下，收银员有权要求老板补发被扣的工资，并可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
二、辞职的合法性及注意事项
- 辞职的合法性：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。在试用期内，劳动者提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。
- 因此，收银员有权根据自己的意愿选择辞职，但应提前通知老板，并按照规定办理离职手续。
- 辞职时的注意事项：
- 保留证据：如果收银员认为老板扣工资的行为非法，应在辞职前收集相关证据，如工资条、扣款通知、与老板的沟通记录等，以便在后续维权时使用。
- 办理离职手续：按照超市的规定办理离职手续，包括交接工作、归还财物等，确保离职过程的顺利进行。
- 主张权益：如果收银员因老板非法扣工资而辞职，且符合《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条规定的情形（如未及时足额支付劳动报酬等），收银员还可以在离职时要求超市支付经济补偿金。经济补偿金的计算方式为：按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
三、后续维权建议
- 与老板协商：如果收银员认为老板扣工资的行为不合理，可以首先尝试与老板进行协商，寻求和解。
- 投诉举报：如果协商无果，收银员可以向当地劳动监察部门投诉老板的违法行为，要求劳动监察部门介入调查并处理。
- 申请劳动仲裁：如果投诉举报后问题仍未得到解决，收银员可以向当地劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，通过法律途径维护自己的合法权益。
总结：虽然收银员有权因老板扣工资而辞职，但在做出决定前应充分考虑后续权益保障问题。如果认为老板的行为非法，应收集证据并按照规定办理离职手续，同时可以通过协商、投诉举报或申请劳动仲裁等方式维护自己的合法权益。如果你有进一步的法律问题或需要更具体的法律建议，可以直接向我咨询。