核心结论：在此种分包有资质、签劳务合同且打卡罚款均由分包负责的场景下，发生工伤时，赔偿主体及方式需分情况讨论，主要取决于分包方是否具备用工主体资格以及劳务合同的具体性质。以下分情况详细说明：
若分包方具备用工主体资格
- 赔偿主体：根据《工伤保险条例》及相关规定，具备用工主体资格的分包方应承担工伤保险责任。这意味着分包方需按照工伤保险的相关标准对受伤员工进行赔偿。
- 赔偿范围：包括但不限于医疗费、康复费、住院伙食补助费、交通食宿费、停工留薪期工资、护理费、一次性伤残补助金、一次性工伤医疗补助金、一次性伤残就业补助金等，具体赔偿项目和标准依据工伤认定结果和伤残等级确定。
- 操作流程：受伤员工应首先向分包方提出工伤认定申请，分包方应在规定时间内（一般为事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内）向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。若分包方未按规定提出申请，受伤员工或其近亲属、工会组织可在1年内直接提出申请。工伤认定后，再根据伤残等级进行劳动能力鉴定，最后依据鉴定结果确定赔偿金额。
若分包方不具备用工主体资格
- 赔偿主体：根据《最高人民法院关于审理工伤保险行政案件若干问题的规定》第三条，社会保险行政部门认定下列单位为承担工伤保险责任单位的，人民法院应予支持：……（四）用工单位违反法律、法规规定将承包业务转包给不具备用工主体资格的组织或者自然人，该组织或者自然人聘用的职工从事承包业务时因工伤亡的，用工单位为承担工伤保险责任的单位。因此，在此情况下，将业务分包给不具备用工主体资格分包方的总包方（或实际用工单位）应承担工伤保险责任。
- 赔偿范围：与具备用工主体资格的分包方承担责任时的赔偿范围相同，涵盖医疗费、康复费等各项工伤保险待遇。
- 操作流程：同样，受伤员工或其近亲属应先向总包方（或实际用工单位）提出工伤认定申请，后续流程与具备用工主体资格分包方情况下的流程一致，即进行工伤认定、劳动能力鉴定，最后依据鉴定结果确定赔偿金额。
特别提醒：无论分包方是否具备用工主体资格，打卡罚款等内部管理行为与工伤赔偿是两个独立的法律关系。打卡罚款若违反法律法规（如罚款金额过高、罚款程序不合法等），受伤员工可另行通过劳动争议仲裁或诉讼等途径维护自己的合法权益，但这并不影响工伤赔偿的认定和支付。
建议：在处理此类工伤赔偿问题时，建议受伤员工或其近亲属及时收集并保存好相关证据（如劳务合同、工作证、考勤记录、医疗证明、工伤认定申请表等），以便在后续的工伤认定、劳动能力鉴定和赔偿协商或诉讼中维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可直接向我咨询。