关于“迟到半个小时扣200全勤是否合法”的问题，我的结论是：这主要取决于公司规章制度的制定程序、内容合理性以及是否符合相关法律法规。若规章制度合法且员工已知悉并同意，则扣除全勤奖可能合法；反之，则可能构成违法行为。 以下是对此问题的详细分析：
一、公司规章制度与劳动合同的合法性
规章制度制定程序：
- 公司有权在规章制度中设定考勤管理等行为规范，但这些规定必须经过民主程序（如职工代表大会讨论通过）并向劳动者公示或告知。只有这样，规章制度才具备法律效力。如果公司未遵循这些程序，那么规章制度可能因程序瑕疵而无效。
劳动合同约定：
- 如果劳动合同或相关文件中明确规定了迟到将扣除全勤奖或相应工资，并且员工已签署同意，那么公司按照约定执行是合法的。但需要注意的是，这种约定必须合法合理，不得违反法律法规的强制性规定。
二、法律法规的遵循
- 根据《中华人民共和国劳动法》等法律法规，员工的工资应当按时足额支付，不得无故克扣或拖欠。因此，公司扣除全勤奖必须有合法依据，且不得违反最低工资标准、加班费等强制性规定。
- 如果公司规章制度中的扣除全勤奖规定违反了法律法规的强制性规定，那么即使规章制度中有相关规定，也可能因违法而无效。
三、规章制度的合理性与公平性
- 公司在设置全勤奖及相应的扣除规则时，应确保其合理性和公平性。例如，全勤奖的金额不应过高，占工资的比例应适中，避免因一次迟到就导致员工工资收入大幅减少。
- 同时，公司应设置合理的迟到次数和时长限制，以及相应的处罚措施，并确保这些规定得到员工的理解和接受。如果扣除全勤奖的规定过于苛刻或不合理，可能引发员工的不满和纠纷。
四、员工权益的保障
- 如果员工认为公司扣除全勤奖的行为不合法或不合理，可以与公司进行协商解决。
- 协商不成的情况下，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。劳动监察部门或劳动仲裁机构将根据相关法律法规和规章制度进行裁决，保护员工的合法权益。
五、具体建议
对于公司：
- 在制定或修改规章制度时，应确保遵循民主程序和公示要求，并充分考虑员工的意见和建议。
- 劳动合同中应明确约定与考勤管理相关的条款，以确保双方权益的明确性。
- 在执行规章制度时，应确保其公平性和合理性，避免因过度惩罚而导致员工的不满和纠纷。
对于员工：
- 在签署劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是与考勤管理相关的部分，确保自己了解并同意相关规定。
- 如果认为公司扣除全勤奖的行为不合法或不合理，可以与公司进行协商或向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
综上所述，迟到半个小时扣200全勤是否合法，需要综合考虑公司规章制度、劳动合同以及相关法律法规的规定。只有在确保各方面都符合法律要求的前提下，公司才能合法地执行相关制度并维护良好的劳动关系。如果您对此问题仍有疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。