针对您提出的问题“如果材料卖1300签了合同最后只收1200怎么开票”，这是一个关于发票开具的实际操作问题，与税务法规和合同执行紧密相关。以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，发票的开具应当基于实际发生的交易金额。在您的情况下，虽然合同上约定的材料售价是1300，但实际收取的金额是1200。因此，在开具发票时，应当按照实际收取的金额1200来开具。
具体操作步骤如下：
确认交易金额：
- 与客户确认实际交易金额为1200，并确保这一金额是双方都认可的。
准备开票资料：
- 收集必要的开票信息，包括客户的名称、纳税人识别号（如果客户是增值税一般纳税人）、地址、电话等。
- 确保您自己的开票信息（如公司名称、纳税人识别号、地址、电话等）也是准确无误的。
开具发票：
- 使用您的开票系统或软件，按照实际交易金额1200开具发票。
- 在发票上明确标注材料名称、规格、数量（如果适用）以及单价和总价。
- 确保发票上的所有信息都是清晰、准确的，并且符合税务部门的要求。
交付发票：
- 将开具好的发票交付给客户，并确保客户收到并确认发票内容无误。
记录与存档：
- 在您的财务记录中准确记录这笔交易，包括合同金额、实际收款金额、发票号码等信息。
- 将发票的存根联或复印件妥善存档，以备税务部门查验。
注意事项：
- 不要按照合同金额1300开具发票，因为这会导致发票金额与实际交易金额不符，可能引发税务风险。
- 如果客户对实际交易金额有异议，应当及时与客户沟通并协商解决，确保双方对交易金额达成一致。
- 遵守税务部门的相关规定和要求，确保发票的开具、交付和存档都符合法律法规的要求。
综上所述，针对您的情况，应当按照实际收取的金额1200来开具发票，并确保发票上的所有信息都是准确无误的。如果您在开票过程中遇到任何问题或疑问，建议及时咨询税务部门或专业的税务顾问以获取更具体的指导和帮助。