结论：单位发现劳动者仲裁证据资料修改了，一般不可以直接报警，但可以根据具体情况采取相应措施。以下从不同角度进行分析：
一、证据修改的性质与法律后果
证据修改的合法性：
- 在劳动仲裁过程中，证据的真实性、合法性和关联性是至关重要的。如果劳动者修改了证据资料，且这种修改影响了证据的真实性，那么这种行为可能构成伪造证据。
- 伪造证据是违法行为，根据《中华人民共和国治安管理处罚法》的相关规定，伪造、隐匿、毁灭证据或者提供虚假证言、谎报案情，影响行政执法机关依法办案的，可能会受到行政处罚，如拘留、罚款等。但这一条款主要适用于影响行政执法机关办案的情形，劳动仲裁并不直接属于行政执法范畴。
- 若修改证据的行为情节严重，还可能触犯《中华人民共和国刑法》中的伪造证据罪，但这一罪名通常适用于刑事诉讼中的伪造证据行为，劳动仲裁作为民事纠纷解决机制，一般不直接涉及刑事犯罪。
对仲裁结果的影响：
- 如果劳动者修改的证据被仲裁庭认定为伪造或虚假，那么该证据将不会被采纳，甚至可能影响劳动者在仲裁中的信誉和裁决结果。
- 仲裁庭有权根据查明的事实和证据作出公正裁决，如果劳动者因伪造证据而误导仲裁庭，仲裁庭有权对其作出不利的裁决。
二、单位的应对措施
提出异议：
- 在仲裁过程中，如果单位发现劳动者提交的证据存在修改痕迹或疑似伪造，应及时向仲裁庭提出异议，并说明理由。
- 仲裁庭将对此进行审查，并根据审查结果决定是否采纳该证据。
收集反证：
- 单位可以积极收集与劳动者修改证据相反的证据，以证明劳动者提交的证据不真实或存在瑕疵。
- 这些反证可能包括原始记录、监控录像、证人证言等，有助于仲裁庭查明事实真相。
申请鉴定：
- 如果单位对劳动者提交的证据的真实性存在严重质疑，且无法通过其他方式证明其真实性，可以向仲裁庭申请对证据进行鉴定。
- 鉴定机构将出具专业的鉴定意见，为仲裁庭提供裁决依据。
法律途径：
- 虽然单位不能直接因劳动者修改证据而报警，但如果劳动者修改证据的行为涉嫌违法或犯罪（如伪造公司印章、文件等），单位可以向公安机关报案，由公安机关依法处理。
- 同时，单位也可以考虑通过民事诉讼途径追究劳动者的法律责任，如要求其赔偿因伪造证据给单位造成的损失等。
三、建议与注意事项
保持冷静与理性：
- 在发现劳动者修改证据后，单位应保持冷静与理性，避免采取过激行为或言辞。
- 应通过合法途径维护自身权益，避免陷入不必要的法律纠纷。
加强证据管理：
- 单位应加强内部证据管理，确保重要文件和记录的完整性和真实性。
- 可以考虑采用电子化存储、定期备份等措施，防止证据被篡改或丢失。
咨询专业律师：
- 在处理此类复杂情况时，建议单位咨询专业律师的意见和帮助。
- 律师将根据具体情况提供针对性的法律建议和解决方案，帮助单位更好地维护自身权益。
有问题可以直接向我咨询，我将根据你的具体情况提供更详细的法律建议。