员工因早吃饭被扣绩效100元，这一行为是否合法，需分情况讨论：

1. 若公司规章制度明确规定了用餐时间，且员工违反该规定，但公司扣绩效缺乏合理性依据：

   • 根据《劳动合同法》及相关劳动法规，公司有权制定规章制度来管理员工，但这些规章制度必须合法、合理，并且不能侵犯员工的合法权益。如果公司规章制度中明确规定了用餐时间，员工确实违反了这一规定，但公司仅因员工早吃饭就扣绩效100元，且这一处罚措施在规章制度中没有明确规定，或者规定不合理（如处罚过重），那么公司的这一行为可能构成违法。因为公司不能随意对员工进行罚款或扣减工资，除非有明确的法律依据或合同约定。

2. 若公司规章制度未明确规定用餐时间，或规定不明确，或扣绩效缺乏制度依据：

   • 如果公司规章制度中并未明确规定用餐时间，或者规定不明确，导致员工对于何时用餐存在合理疑问，那么公司因员工早吃饭而扣绩效的行为就缺乏合法依据。此外，即使规章制度中有相关规定，但如果扣绩效的处罚措施并未在规章制度中明确列出，或者该处罚措施与员工的违规行为不成比例（如轻微违规却受到重罚），那么公司的这一行为也可能被视为违法。

3. 从实际操作和合理性角度分析：

   • 在实际操作中，公司应该通过合理的方式管理员工，包括制定明确的规章制度、提供必要的培训、进行及时的沟通等。如果员工因早吃饭而影响了工作效率或团队氛围，公司可以采取其他合理的措施进行纠正，如提醒、警告、调整工作岗位等，而不是直接扣绩效。因为扣绩效不仅可能影响员工的收入，还可能对员工的职业发展和工作积极性产生负面影响。

法律建议：

• 对于员工而言，如果认为公司的处罚行为违法或不合理，可以先与公司进行沟通协商，寻求解决方案。如果协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
• 对于公司而言，应该制定合法、合理的规章制度，并确保这些规章制度得到员工的知晓和认可。在处罚员工时，应该遵循公平、公正、合理的原则，确保处罚措施与员工的违规行为成比例。

可能后果：

• 如果公司的处罚行为被认定为违法或不合理，可能需要承担相应的法律责任，如支付赔偿金、恢复员工名誉等。同时，公司的形象和声誉也可能受到损害，影响公司的长期发展。

总之，员工因早吃饭被扣绩效100元是否合法，取决于公司的规章制度是否合法、合理以及处罚措施是否与员工的违规行为成比例。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。