针对“落实食品安全过程管控不到位如何立案”的问题，以下是一个详细且深入的解答：

首先，要明确的是，当发现食品安全过程管控不到位的情况时，立案的流程通常涉及多个环节和部门。这主要取决于具体的违规行为和涉及的法律法规。

一、初步调查与证据收集

1. 现场检查：市场监管部门或相关执法机构会首先进行现场检查，核实是否存在食品安全过程管控不到位的情况，如未落实“日管控、周排查、月调度”制度等。
2. 证据收集：执法人员会收集相关证据，包括现场照片、视频、记录文件、证人证言等，以证明违规行为的存在和性质。

二、确定违规行为与法律依据

1. 违规行为认定：根据收集到的证据，执法机构会认定具体的违规行为，如未按规定建立食品安全管理制度、未按规定配备食品安全管理人员、未按责任制要求落实食品安全责任等。
2. 法律依据：依据《企业落实食品安全主体责任监督管理规定》等相关法律法规，确定违规行为的法律性质和可能面临的处罚。例如，根据《企业落实食品安全主体责任监督管理规定》第十八条，对于未按规定落实食品安全责任的企业，市场监督管理部门可以责令整改，给予警告；拒不改正的，可以处以罚款，甚至责令停产停业，直至吊销许可证。

三、立案与移送

1. 立案决定：如果执法机构认为违规行为构成违法，且需要进一步调查和处理，会作出立案决定。
2. 案件移送：对于涉嫌犯罪的食品安全案件，如危害食品安全犯罪活动，执法机构会及时将案件线索移送公安机关，由公安机关依法进行刑事立案和侦查。

四、后续处理与监督

1. 行政处罚：对于不构成犯罪但违反食品安全法规的行为，市场监管部门会依法给予行政处罚，如警告、罚款、责令停产停业等。
2. 法律监督：检察机关会切实做好审查批捕和起诉工作，对行政执法机关移送涉嫌犯罪情况实行监督，确保侦查、起诉、审判、执行工作依法有序进行。
3. 社会监督：同时，也会加强社会监督，鼓励公众举报食品安全违法行为，形成社会各界共同抵制、打击危害食品安全违法犯罪活动的强大舆论声势。

五、具体案例参考

以屯昌某校未落实食品安全“日管控、周排查、月调度”制度案为例，该校因未按规定落实食品安全责任，被屯昌县市场监督管理局依法将涉嫌违法案件线索移交屯昌县综合行政执法局，并最终受到了警告和罚款的行政处罚。

综上所述，落实食品安全过程管控不到位的立案流程涉及初步调查、证据收集、违规行为认定、法律依据确定、立案与移送以及后续处理与监督等多个环节。在处理此类案件时，应严格依法办事，确保食品安全法规得到有效执行。