当自家的宅基地被邻居占领了一部分时，您完全有权通过法律途径来维护自己的合法权益。以下是一些详细的步骤和建议，希望能帮助您更好地处理这个问题：

一、明确权属与准备证据

首先，您需要明确宅基地的权属，确保自己拥有合法的宅基地使用权。为此，您可以准备宅基地使用证、建房审批文件等相关材料，这些材料是维权的重要依据。同时，您还需要收集邻居侵占宅基地的证据，如现场照片、证人证言等，以便在后续的协商或诉讼中使用。

二、尝试友好协商

在明确了权属和准备好了证据之后，您可以尝试与邻居进行友好协商，要求他们停止侵占行为并归还被侵占的宅基地。在协商过程中，您可以展示相关证据，说明自己的合法权益，并尝试达成一个双方都能接受的解决方案。

三、申请调解

如果协商无果，您可以向乡镇政府或县级以上政府农业农村主管部门申请调解。这些部门通常会派遣专业人员进行调解，帮助双方达成和解协议。在调解过程中，您需要如实陈述事实，提供相关证据，并积极配合调解人员的调解工作。

四、提起民事诉讼

如果调解仍然无法解决问题，您可以向法院提起民事诉讼。在诉讼请求中，您可以要求邻居停止侵权行为，返还被侵占的宅基地，并赔偿因侵占行为给您造成的经济损失。在诉讼过程中，您需要严格遵循法定程序，按时参加庭审，并积极配合法院的调查工作。

五、申请强制执行

如果法院判决后，邻居仍然拒不履行判决，您可以向法院申请强制执行。通过法律手段，法院将有权采取一系列强制措施，如查封、扣押、拍卖等，以迫使邻居履行判决，从而恢复您对宅基地的合法使用权益。

总之，当自家的宅基地被邻居占领了一部分时，您应该积极采取法律手段来维护自己的合法权益。通过明确权属、准备证据、友好协商、申请调解、提起民事诉讼以及申请强制执行等步骤，您可以有效地解决这个问题，并恢复自己对宅基地的合法使用权益。