结论前置：公司不能随意以库存对不上为由扣工资，需分情况处理，若公司扣工资不合理，你可以通过协商、投诉或申请劳动仲裁来维权。以下是具体分析：
公司扣工资的合法性分析
- 若公司有证据证明库存差异是因你故意或重大过失造成
- 根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
- 例如，你故意将库存物品私自拿走或者严重疏忽导致大量物品损坏丢失，公司有监控录像、物品出入库记录等证据证明是你的责任，那么公司可以按照上述规定从你工资中扣除相应损失，但扣除比例和剩余工资有法定限制。
- 若公司无法证明库存差异是你故意或重大过失造成
- 公司不能随意扣你工资。因为库存对不上可能存在多种原因，比如公司本身的库存管理系统存在漏洞、其他员工操作失误、货物自然损耗等，不能简单地将责任归咎于你。
- 例如，公司没有完善的库存盘点制度，之前就存在库存数据不准确的情况，或者在你工作期间，其他员工未经授权拿走了货物，这些情况下公司扣你工资就是没有法律依据的。
应对措施
- 与公司协商
- 你可以先与公司沟通，要求公司出示证明库存差异是你责任的相关证据。如果公司无法提供，你可以明确表示不同意扣工资。
- 在协商过程中，要保持冷静和理性，以事实为依据，说明自己工作期间的情况，争取通过友好协商解决问题。
- 向劳动监察部门投诉
- 如果协商无果，你可以向当地劳动监察部门投诉。劳动监察部门会依法对公司的行为进行调查，如果发现公司存在违法扣工资的行为，会责令公司限期支付工资，并可能对公司进行相应的处罚。
- 投诉时，你需要准备好相关的证据，如劳动合同、工资条、工作记录等，以证明自己的权益受到了侵害。
- 申请劳动仲裁
- 若对劳动监察部门的处理结果不满意，或者公司拒绝执行劳动监察部门的责令，你可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。
- 在仲裁过程中，你需要提交仲裁申请书、相关证据等材料，仲裁委员会会根据事实和法律进行裁决。如果仲裁裁决支持你的诉求，公司必须履行裁决结果，否则你可以向法院申请强制执行。
如果你在处理这个问题过程中遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会为你提供详细的解答。