超过劳动仲裁时效并不意味着绝对不能确认劳动关系，具体能否确认需根据案件的具体事实、证据以及是否存在时效中断、中止等特殊情形来判断。以下是对此问题的详细分析：
一、仲裁时效的基本规定
根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。这是确认劳动关系争议仲裁时效的基本规定。
二、仲裁时效的中断与中止
仲裁时效中断：
- 若劳动者向用人单位主张权利、向有关部门请求权利救济，或用人单位同意履行义务等，将导致仲裁时效中断。从中断时起，仲裁时效期间重新计算。
- 例如，劳动者在知道权利被侵害后，及时向用人单位提出异议，或向劳动监察部门投诉，这些行为都可能构成时效中断。
仲裁时效中止：
- 因不可抗力或有其他正当理由，导致劳动者无法在时效期内申请仲裁的，仲裁时效中止。从中止时效的原因消除之日起，仲裁时效期间继续计算。
- 例如，劳动者因重大疾病无法及时申请仲裁，待病情好转后，可继续计算时效期间。
三、超过仲裁时效的法律后果与司法实践
法律后果：
- 若超过仲裁时效且不存在时效中断、中止的情形，仲裁机构可能不予受理劳动者的仲裁申请。但即便如此，劳动者仍可依法向人民法院提起诉讼。
司法实践：
- 法院在受理案件后，会依职权主动审查仲裁时效问题。若经审查确认超过仲裁时效，且不存在时效中止、中断的法定情形，法院将从实体上驳回劳动者要求确认劳动关系的诉讼请求。
- 但若劳动者能证明存在时效中断、中止的情形，或法院认为确认劳动关系对于保障劳动者权益具有重大意义（如涉及工伤赔偿、社会保险缴纳等），法院则可能继续审理并依法裁判。
四、实际操作建议
及时行使权利：
- 劳动者在知道或应当知道权利被侵害后，应尽快向仲裁机构或法院提出申请，避免超过仲裁时效。
收集证据：
- 劳动者应收集并保存与劳动关系确认相关的证据材料，如劳动合同、工资单、工作证等，以便在仲裁或诉讼过程中证明自己的主张。
关注特殊情形：
- 若因特殊原因（如不可抗力、重大疾病等）导致无法及时申请仲裁，劳动者应及时向仲裁机构或法院说明情况，并提供相应证据，以争取时效中止或中断的认定。
举例说明：假设劳动者小张在2022年1月发现用人单位未与其签订书面劳动合同，且未缴纳社会保险。小张在2023年3月才向仲裁机构提出确认劳动关系的申请。此时，若小张无法证明存在时效中断、中止的情形，仲裁机构可能以超过仲裁时效为由不予受理。但若小张能证明在2022年期间曾多次向用人单位主张权利，或因不可抗力导致无法及时申请仲裁，则可能构成时效中断或中止，仲裁机构或法院将依法进行审理。
综上所述，虽然超过仲裁时效可能会对劳动关系的确认产生不利影响，但并非绝对。具体是否能够确认劳动关系，还需综合考虑案件的具体事实、证据以及是否存在时效中断、中止等特殊情形。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。